L'INPN diffuse l'information de nombreux programmes nationaux qui ont des méthodologies, des logiques de validation et de diffusion propres. Ces programmes peuvent être regroupés en 3 grands ensembles et interrogés de façon spécifique.

Programme « Référentiels et statuts »

• le référentiel taxonomique national « TAXREF »
• le référentiel des réglementations espèces(en lien avec TAXREF)
• les listes rouges nationales (en lien avec TAXREF)
• les plans nationaux d'actions
• les typologies « habitats » nationales

Programme « Espaces »

• ZNIEFF: diffusion des données descriptives et cartographiques
• Natura 2000: diffusion des données descriptives et cartographiques
• Espaces protégés français : diffusion des données descriptives et cartographiques
• Inventaire national du Patrimoine Géologique (InPG) : diffusion des données descriptives et cartographiques (à venir)

Programme « Répartition et évaluation»

• diffusion des données des inventaires nationaux
• diffusion des données des programmes d'évaluation de l'état de conservation DHFF

L'INPN diffuse également des données complémentaires

• Les données de programmes spécifiques (hors inventaire nationaux) :
  • ATBI Mercantour,
  • sciences participatives,
  • collection
  • ...
• Autres statuts des espèces : listes rouges internationales et européennes.