Les aléas naturels de type tempête et coup de mer sont favorables localement à la dynamique de cet écosystème, ils engendrent des intrusions marines par rupture ou submersion du premier cordon dunaire dans les secteurs les plus exposés.
Ce cordon dunaire, parsemé de chemins permettant d'accéder à la plage, devient chaque été le lieu de rassemblement d'un tourisme balnéaire de masse qui dégrade les habitats (érosion des sols et piétinement des espèces végétales) : passage pédestre ou de véhicules motorisés, dépôts d'ordures etc. L'augmentation de la consommation d'espace par l'urbanisation et leur artificialisation, détruisent ces habitats.
Pour conserver le patrimoine de la ZNIEFF, déjà en mauvais état de conservation, il faudra intervenir au minimum pour laisser agir les aléas naturels. La gestion de la fréquentation humaine s'impose : passages piétonniers aménagés, signalétique des cheminements, etc. L'application des obligations résultant de la loi Littoral et concernant la circulation des véhicules à moteur permettrait de favoriser la conservation du patrimoine de la ZNIEFF.
Un contrôle des espèces végétales envahissantes comme l'Herbe de la Pampa (Cortaderia selloana) ou la Canne de Provence (Arundo donax) serait à assurer pour éviter l'invasion de ce secteur dunaire.
La ZNIEFF des Dunes de Capellans se situe sur le littoral catalan. Elle s'étend sur 18 hectares, depuis Saint-Cyprien-Plage jusqu'à Saint-Cyprien-Sud.
Cette ZNIEFF littorale caractéristique est composée d'une plage, de dunes et de milieux arrières-dunaires.
Les abords de ce cordon littoral subissent une forte artificialisation: vaste complexe touristique des Capellans composé d'un port aménagé dans la lagune, de résidences, d'une facilité d'accès à la zone en voiture. En outre, celle-ci s'accompagne d'une intense fréquentation humaine sur le lido.
La ZNIEFF englobe l'ensemble du lido. Le périmètre est délimité à l'est par la mer Méditerranée, à l'ouest par la berge du port des Capellans. Au nord, le tracé s'arrête aux zones urbanisées de Saint-Cyprien-Plage, au sud à celles de Saint-Cyprien-Sud.