Le pech de la Guide (relativement peu dégradé ou morcelé) offre des milieux calcaires méso-xérophiles (prairies de fauche, pelouses calcaires, boisements thermophiles...) riches en plantes méridionales dont certaines sont rares en Lot-et-Garonne ou en Aquitaine. Le Pech de la Guide constitue un site à orchidées remarquables.
Sont exclus les milieux dégradés ou trop artificialisés bordant le pech (cultures, vergers, batîments, mares artificielles).