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Cours d'eau typique de la haute Cévenne, la Fontolière s'écoule d'ouest en est dans une vallée encaissée ; cette topographie lui confère un microclimat rigoureux qui influe sur la faune (c'est le cas pour les libellules). La bonne qualité de l'eau permet aux Ecrevisses à pattes blanches de se maintenir dans ce secteur du cours d'eau appartenant à la zone à Truite fario. La présence de la Loutre est avérée ; celle du Sonneur à ventre jaune est très ponctuelle, voire rélictuelle ; il est localisé uniquement dans les vasques du lit majeur. L'humidité relativement importante de la vallée et la variabilité des micro-habitats aquatiques favorisent les espèces d'amphibiens et de reptiles affiliés à ces types de milieux, parmi lesquelles la Salamandre tachetée.
