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Le massif calcaire du Bas-Bugey est une région d’une très grande richesse biologique. A l'écart des principales voies de communication, il reste bien préservé. Mais c'est sa physionomie qui présente le plus d'intérêt. De la plaine du Rhône au sommet du massif (Molard Dedon, 1219 m), le dénivelé est de près de 1000 m. Les conditions climatiques rencontrées sur l'ensemble du massif sont particulièrement variées et permettent une grande diversité botanique. Les milieux rencontrés sont aussi divers que tourbières, lacs, forêts montagnardes, pelouses sèches, pâturages, falaises... Son orientation nord-ouest et sud-est suit le cours du Rhône. Elle favorise la pénétration de la flore méditerranéenne. Les coteaux du Bas-Bugey qui dominent la vallée du Rhône offrent (du fait de l'aridité et de l'ensoleillement) de nombreuses espèces méditerranéennes parfois en limite d'aire. Le site est situé à l'extrémité du massif du Jura méridional. Cette gorge est particulièrement bien exposée ce qui explique la présence d'espèces méditerranéennes telles que l'Erable de Montpellier, le Pistachier térébinthe, le Rouvet…
Dans le domaine de la faune, les chauve-souris sont ainsi particulièrement bien représentées avec les grotte de Pierre-Châtel (Grotte des Romains et Grotte des Sarrasins), sites qui présentent un intérêt de niveau international pour celles-ci, avec l'observation d'effectifs importants appartenant à cinq espèces différentes.
