Signe non équivoque de la richesse de son patrimoine naturel, la Chartreuse est riche de quatre-vingt dix espèces botaniques protégées et la plupart des ongulés de France (à l’exception du Bouquetin des Alpes) hantent son territoire. Les boisements mixtes feuillus et conifères situés à proximité du village de la Ruchère abritent une rare orchidée : l’emblématique Sabot de Vénus, encore appelé "Pantoufle de Notre-Dame" du fait de la forme de sa fleur. La pollinisation est effectuée par des Hyménoptères (insectes de la famille des mouches) pénétrant par l’orifice principal du labelle. Lors de leur sortie, ils entrent en contact avec l’une ou l’autre des étamines et transportent ainsi le pollen. Sur le même trajet (en général dans une autre fleur) ils déposent le pollen sur les stigmates. Représentant la plus célèbre des orchidées de la flore européenne, c’est une espèce rare, tant en ce qui concerne le nombre de stations que les effectifs de celles-ci ; le risque d'extinction est donc réel.