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Le massif du Pilat est situé sur la bordure est du Massif Central. Les influences climatiques sont ici multiples : continentale, montagnarde, océanique, méditerranéenne. La Combe de Vert est située au rebord du plateau pélussinois, dans les forêts de feuillus de l’étage collinéen ; elle s'étage entre 650 et 800 m d’altitude. Les boisements de feuillus sont ici dominants et relativement diversifiés. On trouve entre autres de nombreux hêtres et châtaigniers. Dans les secteurs les plus ombragés et frais, on peut observer l'Ophioglosse (ou "Langue de serpent"). Cette fougère, assez répandue en France, est protégée en région Rhône-Alpes. Son unique feuille est composée d’une limbe ovale et d’un épi de sporanges lui donnant l'aspect d'une langue de serpent. C’est dans ce secteur également que l’on retrouve une orchidée rare et protégée en région Rhône-Alpes : l’Orchis à fleurs lâches. Le nom de cette orchidée fait allusion à l’aspect de l’inflorescence. Sa floraison très contrastée (d'un rouge violet foncé avec la partie centrale blanche et non maculée) a lieu vers Pentecôte. En amont est présente une autre orchidée : l’Orchis punaise. Celle-ci est protégée en France. Elle est en forte régression du fait de la raréfaction de ses habitats.
