La ZNIEFF du "Cordon dunaire de la Rouquette" se situe sur le littoral audois, en face du massif de la Clape. Elle occupe un peu moins de 70 hectares de plage et d'arrière plage de la commune de Narbonne.
Le paysage se compose d'un cordon dunaire qui s'étire sur 1700 m de long et atteint 750 m dans sa plus grande largeur. Il est constitué de dunes en front de mer protégeant en arrière dune une dépression colonisée par des prés salés et des sansouires. Ce cordon littoral est situé au contact des stations touristiques balnéaires de Narbonne-Plage au nord-est et des Ayguades au sud-ouest (commune de Gruissant). Il est aisément accessible depuis route départementale D332 qui le long à l'ouest et est très fréquenté. C'est un espace sensible exposé à la pression anthropique avec l'urbanisation de sa zone arrière dunaire comme en témoignent un parc d'attraction aquatique, un parking et des campings.
La dépression en arrière des dunes témoigne des échanges hydrauliques qui s'opèrent avec la mer par l'aquifère et latéralement par l'étang des Ayguades lors de coups de mer. Les milieux de la ZNIEFF forment ainsi un système dynamique. Cette situation se traduit par des faciès de végétation caractéristiques et confère à cette zone un intérêt floristique et ornithologique.
Une dizaine de plantes déterminantes caractérise cette zone, avec des espèces liées d'une part aux milieux sableux des dunes, d'autre part aux milieux halophiles en arrière du cordon. La végétation dunaire abrite des espèces typiques des substrats sableux (espèces psammophiles) comme par exemple : l'Euphorbe péplis (Euphorbia peplis), espèce protégée au niveau national qui croit préférentiellement sur le haut des plages et en avant dune ; la Crucianelle maritime (Crucianella maritima), espèce strictement méditerranéenne inféodée aux dunes fixées ; le Faux-orlaya nain (Pseudorlaya pumila), espèce protégée au niveau national liée aux zones ouvertes et écorchées de la dune et de l'arrière dune... En arrière dune, au sein des étendues temporairement humides et salées, s'observent des espèces du cortège des Saladelles avec notamment : le Grand statice (Limoniastrum monopetalum), espèce protégée au niveau national qui possède dans l'Aude la quasi totalité de ses populations naturelles en France ; le Statice à feuilles de pâquerette (Limonium bellidifolium) ; le Statice de Legrand (Limonium legrandii), espèce considérée comme endémique languedocienne des prés salés littoraux entre le nord des Pyrénées-Orientales et l'ouest de l'Hérault ; le Myriolimon férule (Myriolimon ferulaceum), espèce ouest méditerranéenne qui atteint sa limite orientale de distribution vers Agde.
Le cordon dunaire remplit par ailleurs un rôle important pour la nidification, l'alimentation et le repos de quelques espèces déterminantes d'oiseaux. Il accueille en particulier les reproductions du Gravelot à collier interrompu (Charadrius alexandrinus) et de la rare Sterne à front blanc (Sternula albifrons).
Le périmètre englobe l'ensemble fonctionnel et interconnecté constitué par le système dunaire et son arrière dune entre la station balnéaire de Narbonne Plage et l'étang des Ayguades. Il est délimité par :
- au sud-est, la mer ;
- au nord-ouest, la D332 ou les zones urbanisées (parc d'attraction nautique et parking côté Narbonne Plage) ;
- au nord-est, la limite avec l'urbanisation de Narbonne Plage ;
- au sud-ouest, la berge de l'étang des Ayguades et de son grau, ainsi que la limite avec le camping "la Côte des Roses".