Ce site accueille deux populations bien distinctes de Choux insulaire (Brassica insularis Moris var. insularis) dont celle de Caporalino constitue la deuxième population la plus importante connue de Corse. Espèce rare et menacée au niveau mondial, variété endémique de Corse, sa présence constitue la première motivation à la création d’une ZNIEFF de Type I. Protection nationale. Le Monte Supietra est un site majeur pour la conservation des chiroptères de Corse, en particulier la faille qui fracture le massif. Cette faille offre une cavité qui accueille la plus grande population hivernante de Minioptère de Schreibers (max. 5000 individus) connue en Corse, mais aussi le Grand Rhinolophe (100 individus). On recense au total cinq espèces de chiroptères déterminants, protégées au niveau national et inscrits dans les annexes II et IV de la Directive Habitat.
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