Les peuplements présents dans la ZNIEFF correspondent pour partie à des habitats déterminants pour les ZNIEFF de Corse :
1210 : Végétation annuelle des laisses de mer, qui correspond baux bancs de galets occupés par une végétation très éparse ;
3170 : Mares temporaires méditerranéennes (type 1 des cahiers d’habitats : Mares temporaires méditerranéennes à Isoètes (Isoetion)), qui regroupent les petites zones humides temporaires qui se développent au niveau des cuvettes liées à la microtopographie dans les terrasses proches du lit vif alimentées lors des hautes eaux. Sur le site, ces groupements n’occupent pas une grande ampleur et se limitent à des chapelets de zones hygrophiles de très petite surface. Les cortèges floristiques ne présentent pas les enjeux exceptionnels des mares temporaires emblématiques du Cap Corse ou de Corse du Sud, mais regroupent des espèces caractéristiques de l’habitat.
3290 : Rivières intermittentes méditerranéennes du Paspalo-Agrostidion, qui correspondent à l’ensemble du lit graveleux des deux cours d’eau. On y relève, en mosaïque avec les fourrés de saules, des cortèges floristiques où se mêlent des espèces hygrophiles caractéristiques de berges de lit vif et des espèces nitrophiles caractéristiques de limons remaniés riches en matière organique. Les fourrés de saules peuvent être rattachés à l’habitat.
92A0 : Forêts galeries à Salix alba et Populus alba (faciès à aulne glutineux) qui se présentent sous forme de chapelets discontinus le long des berges des cours d’eau ;
92D0 : Galeries et fourrés riverains méridionaux (Nerio-Tamaricetea et Securinegion tinctoriae) qui s’observent à l’amont de l’embouchure du Fiume secco.
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