| Code | Nom | Fiche |
|---|---|---|
| FR4301323 | Basse vallée du Doubs |
|
| FR4301280 | Bassin du Drugeon |
|
| FR4301306 | Bresse jurassienne |
|
| FR4301310 | Combe du Lac |
|
| FR4301315 | Combe du Nanchez |
|
| FR4301330 | Complexe des Sept Lacs du Jura |
|
| FR4302001 | Côte de Mancy |
|
| FR4301328 | Entrecôtes du Milieu - Malvaux |
|
| FR4301327 | Étival - Assencière |
|
| FR4301320 | Forêt du Massacre |
|
| FR4301332 | Forêts, corniches calcaires, ruisseaux et marais de Vulvoz à Viry |
|
| FR4301313 | Grandvaux |
|
| FR4301318 | Massif de la Serre |
|
| FR4301319 | Massif du Risoux |
|
| FR4301334 | Petite montagne du Jura |
|
| FR4301316 | Plateau du Lizon |
|
| FR4301321 | Reculée des Planches près Arbois |
|
| FR4301322 | Reculées de la Haute Seille |
|
| FR4301351 | Réseau de cavités à Minioptères de Schreibers en Franche-Comté (12 cavités) |
|
| FR4301309 | Tourbières et lacs de Chapelle-des-Bois et de Bellefontaine les Mortes |
|
| FR4301308 | Vallée de l'Orbe |
|
| FR4301291 | Vallées de la Loue et du Lison |
|
| FR4301331 | Vallées et côtes de la Bienne, du Tacon et du Flumen |
|
| FR4301317 | Vallons forestiers, rivières, ruisseaux, milieux humides et temporaires de la forêt de Chaux |
|
| Code | Nom | Fiche |
|---|---|---|
| FR4312007 | Basse vallée du Doubs |
|
| FR4310112 | Bassin du Drugeon |
|
| FR4312008 | Bresse jurassienne |
|
| FR4312027 | Complexe des Sept Lacs du Jura |
|
| FR4312023 | Entrecôtes du Milieu-Malvaux |
|
| FR4312022 | Étival - Assencière |
|
| FR4312005 | Forêt de Chaux |
|
| FR4312003 | Forêt du Massacre |
|
| FR4312021 | Massif de la Serre |
|
| FR4312002 | Massif du Risoux |
|
| FR4312013 | Petite montagne du Jura |
|
| FR4312026 | Plateau du Lizon |
|
| FR4312025 | Reculée des Planches près d'Arbois |
|
| FR4312016 | Reculées de la haute Seille |
|
| FR4312029 | Vallée de l'Orbe |
|
| FR4312009 | Vallées de la Loue et du Lison |
|
| FR4312012 | Vallées et côtes de la Bienne, du Tacon et du Flumen |
|
