Fundado em 1963 junto com o Departamento de Botânica da UnB. Eminentes botânicos já foram curadores do UB. Dra. Graziela Maciel Barroso, cedida pelo Jardim Botânico do Rio de Janeiro na década de 1960, foi curadora até 1968 sendo substituida pelo famoso botânico amazônico João Murça Pires. Dr. George Eiten, importante pelas suas publicações pioneiras em cerrado, e hoje professor emérito da Universidade de Brasília foi curador por curto período. O herbário UB funciona no mesmo local desde a sua criação, na ala sul do Instituto Central de Ciências. O acervo possui cerca de 190 mil fanerógamas e 40 mil criptógamas (1.600 tipos). Quanto à representação geográfica, são amostras principalmente do planalto central e do bioma Cerrado (coleções expressivas do Distrito Federal, Goiás, Maranhão, Minas Gerais, Mato Grosso e Tocantins), Amazônia (permutas sob Curadoria do Dr. João Murça Pires), Mata Atlântica (Permutas sob curadoria do Dra. Graziela Maciel Barroso e Myrtaceae do Paraná) e Exterior (Permutas sob curadoria do Dr. George Eiten)
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