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EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods
Description :
EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods
Link GBIF portal : https://www.gbif.org/dataset/20b968fd-b7e0-4002-9136-1ccfa8e5b9df
Project :
Title : EMOSE (2017) Inter-Comparison of Marine Plankton Metagenome Analysis Methods
Abstract :
Funding :
Contact : ()
Le jeu de données diffusé est issu d'un traitement automatique appliqué sur les données issues du GBIF. Les règles de l'INPN et plus globalement du SINP (en termes de périmètre et de contrôle sur les données) peuvent impliquer que l'ensemble des données du jeu source ne soit pas restitué dans le SINP.
The disseminated dataset stems from an automatic treatment applied to data coming from GBIF. INPN rules, and more generally SINP rules (in terms of perimeter and data quality controls) may imply that the whole of the source dataset might not be provided on the SINP platform.
Contacts
Type
Organisme
Nom
Fournisseur
The French National Sequencing Center (Genoscope)
Producteur
The French National Sequencing Center (Genoscope)
Dates publication :
Premiere diffusion : 24/09/2019
Dernière mise à jour : 30/11/2023
Liste des espèces répertoriées :
Filtrer par Règne
Archaea
Bacteria
Chromista
Fungi
Plantae
Protozoa
Filtrer par Classe
Halobacteria
Nitrososphaeria
Acidimicrobiia
Actinobacteria
Alphaproteobacteria
Bacilli
Balneolia
Betaproteobacteria
Chitinivibrionia
Clostridia
Coriobacteriia
Cyanophyceae
Cytophagia
Deinococci
Deltaproteobacteria
Epsilonproteobacteria
Erysipelotrichia
Flavobacteria
Fusobacteriia
Gammaproteobacteria
Holophagae
Mollicutes
Negativicutes
Oligoflexia
Opitutae
Phycisphaerae
Planctomycetacia
Rhodothermia
Saprospiria
Sphingobacteriia
Spirochaetes(Class)
Synergistia
Verrucomicrobiae
Aconoidasida
Bacillariophyceae
Bicoecea
Chlorarachnea
Chrysophyceae
Conoidasida
Cryptophyceae
Dictyochophyceae
Dinophyceae
Eustigmatophyceae
Globothalamea
Goniomonadophyceae
Granofilosea
Gregarinomorpha
Heterotrichea
Imbricatea
Katablepharidophyceae
Kinetofragminophora
Labyrinthulea
Litostomatea
Nassophorea
Oligohymenophorea
Oligotrichea
Pavlovophyceae
Pelagophyceae
Perkinsea
Peronosporea
Phaeophyceae
Phyllopharyngea
Phytomyxea
Prostomatea
Prymnesiophyceae
Raphidophyceae
Spirotrichea
Synurophyceae
Thecofilosea
Tubothalamea
Xanthophyceae
Agaricomycetes
Agaricostilbomycetes
Arthoniomycetes
Chytridiomycetes
Dothideomycetes
Entomophthoromycetes
Eurotiomycetes
Glomeromycetes
Leotiomycetes
Malasseziomycetes
Mucoromycetes
Pezizomycetes
Saccharomycetes
Sordariomycetes
Taphrinomycetes
Bangiophyceae
Chlorodendrophyceae
Chlorophyceae
Compsopogonophyceae
Florideophyceae
Glaucophyceae
Mamiellophyceae
Nephroselmidophyceae
Porphyridiophyceae
Prasinophyceae
Pyramimonadophyceae
Stylonematophyceae
Trebouxiophyceae
Ulvophyceae
Choanoflagellatea
Discosea
Euglenoidea
Glissodiscea
Heterolobosea
Ichthyosporea
Kinetoplastea
Myxomycetes
Picomonadea
Tubulinea
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Bacteroidales
Corticiales
Cystofilobasidiales
Dacrymycetales
Gemmatales
Lentisphaerales
Marinilabiliales
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Pucciniales
Trechisporales
Tremellales
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Haemospororida
Actinomycetales
Bifidobacteriales
Corynebacteriales
Euzebyales
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Propionibacteriales
Cantharellales
Agaricostilbales
Caulobacterales
Hyphomicrobiales
Kiloniellales
Kordiimonadales
Magnetococcales
Parvularculales
Rhizobiales
Rhodobacterales
Rhodospirillales
Rickettsiales
Sneathiellales
Sphingomonadales
Arthoniales
Achnanthales
Anaulales
Asterolamprales
Bacillariales
Biddulphiales
Chaetocerotanae incertae sedis
Corethrales
Coscinodiscales
Cyclophorales
Cymatosirales
Cymbellales
Fragilariales
Hemiaulales
Leptocylindrales
Licmophorales
Lithodesmiales
Melosirales
Naviculales
Paraliales
Protoraphidales
Rhaponeidales
Rhizosoleniales
Striatellales
Surirellales
Thalassionematales
Thalassiophysales
Thalassiosirales
Toxariales
Triceratiales
Bacillales
Caryophanales
Lactobacillales
Balneolales
Bangiales
Burkholderiales
Neisseriales
Nitrosomonadales
Anoecida
Bicoecida
Chitinivibrionales
Chlorachniida
Chlorodendrales
Chlamydomonadales
Sphaeropleales
Volvocales
Acanthoecida
Craspedida
Chromulinales
Chytridiales
Clostridiales
Eubacteriales
Halanaerobiales
Erythropeltidales
Rhodochaetales
Eucoccidiorida
Coriobacteriales
Cryptomonadales
Pyrenomonadales
Chroococcales
Chroococcidiopsidales
Nostocales
Oscillatoriales
Pseudanabaenales
Spirulinales
Synechococcales
Cytophagales
Thermales
Bradymonadales
Desulfarculales
Desulfobacterales
Desulfovibrionales
Desulfuromonadales
Myxococcales
Syntrophobacterales
Dictyochales
Pedinellales
Pinguiochrysidales
Blastodiniales
Coccidiniales
Dinophyceae incertae sedis
Dinophysiales
Gonyaulacales
Gymnodiniales
Noctilucales
Oxyrrhinales
Peridiniales
Phytodiniales
Prorocentrales
Pyrocystales
Suessiales
Syndiniales
Tovelliales
Centramoebida
Dactylopodida
Vannellida
Pleosporales
Entomophthorales
Campylobacterales
Erysipelotrichales
Euglenida
Eutreptiida
Chaetothyriales
Eustigmatales
Flavobacteriales
Acrochaetiales
Bonnemaisoniales
Ceramiales
Corallinales
Gracilariales
Hapalidiales
Nemastomatales
Peyssonneliales
Plocamiales
Rhodymeniales
Fusobacteriales
Acidithiobacillales
Aeromonadales
Alteromonadales
Arenicellales
Cardiobacteriales
Cellvibrionales
Chromatiales
Enterobacterales
Enterobacteriales
Immundisolibacterales
Legionellales
Lysobacterales
Methylococcales
Nevskiales
Oceanospirillales
Pasteurellales
Pseudomonadales
Thiotrichales
Vibrionales
Xanthomonadales
Glaucocystales
Ancyromonadida
Lituolida
Rotaliida
Diversisporales
Glomerales
Goniomonadales
Leucodictyida
Archigregarinorida
Eugregarinida
Halobacteriales
Haloferacales
Schizopyrenida
Heterotrichida
Acanthopleuribacterales
Eccrinida
Euglyphida
Marimonadida
Thaumatomonadida
Katablephariales
Apostomatida
Eubodonida
Parabodonida
Trypanosomatida
Labyrinthulida
Thraustochytrida
Erysiphales
Helotiales
Thelebolales
Cyclotrichiida
Haptorida
Malasseziales
Mamiellales
Haloplasmatales
Mucorales
Physarales
Microthoracida
Acidaminococcales
Nephroselmidales
Nitrosopumilales
Bdellovibrionales
Oligoflexales
Peniculida
Peritrichida
Philasterida
Pleuronematida
Sessilida
Choreotrichida
Oligotrichida
Puniceicoccales
Pavlovales
Pelagomonadales
Sarcinochrysidales
Perkinsida
Peronosporales
Saprolegniales
Pezizales
Dictyotales
Ectocarpales
Fucales
Sphacelariales
Phycisphaerales
Chlamydodontida
Dysteriida
Endogenida
Exogenida
Plasmodiophorida
Picomonadida
Planctomycetales
Porphyridiales
Halosphaerales
Prorodontida
Coccolithales
Isochrysidales
Phaeocystales
Prymnesiales
Syracosphaerales
Pyramimonadales
Chattonellales
Rhodothermales
Saccharomycetales
Saprospirales
Hypocreales
Lulworthiales
Ophiostomatales
Sphingobacteriales
Spirochaetales
Euplotida
Stylonematales
Synergistales
Synurales
Taphrinales
Cryomonadida
Tectofilosida
Chlorellales
Oocystales
Trebouxiales
Miliolida
Euamoebida
Leptomyxida
Cladophorales
Oltmannsiellopsidales
Ulvales
Verrucomicrobiales
Mischococcales
Filtrer par Famille
Amphisiellidae
Dermocystidae
Holostichidae
Oxytrichidae
Plectosphaerellaceae
Reophacidae
Urostylidae
Acanthoecidae
Stephanoecidae
Acanthopleuribacteraceae
Achnanthidiaceae
Cocconeidaceae
Acidaminococcaceae
Iamiaceae
Acidithiobacillaceae
Acrochaetiaceae
Mycobacteriaceae
Aeromonadaceae
Agaricostilbaceae
Alteromonadaceae
Colwelliaceae
Ferrimonadaceae
Idiomarinaceae
Moritellaceae
Pseudoalteromonadaceae
Shewanellaceae
Anaulaceae
Ancyromonadidae
Caecitellidae
Foettingeriidae
Selenidiidae
Arenicellaceae
Roccellaceae
Asterolampraceae
Bacillaceae
Paenibacillaceae
Staphylococcaceae
Bacillariaceae
Bacteroidaceae
Dysgonomonadaceae
Marinifilaceae
Prevotellaceae
Prolixibacteraceae
Rikenellaceae
Balneolaceae
Bangiaceae
Bdellovibrionaceae
Bicosoecaceae
Cafeteriaceae
Biddulphiaceae
Bifidobacteriaceae
Blastodinidae
Paradinophycidae
Bonnemaisoniaceae
Bradymonadaceae
Alcaligenaceae
Burkholderiaceae
Comamonadaceae
Oxalobacteraceae
Campylobacteraceae
Helicobacteraceae
Botryobasidiaceae
Cardiobacteriaceae
Listeriaceae
Thermoactinomycetaceae
Hyphomonadaceae
Maricaulaceae
Cellvibrionaceae
Halieaceae
Spongiibacteraceae
Acanthamoebidae
Callithamniaceae
Ceramiaceae
Dasyaceae
Delesseriaceae
Rhodomelaceae
Wrangeliaceae
Attheyaceae
Chaetocerotaceae
Herpotrichiellaceae
Chattonellaceae
Chitinivibrionaceae
Lynchellidae
Chlorococcaceae
Coccomyxaceae
Chlorarachniaceae
Chlorellaceae
Chlorodendraceae
Codonellidae
Codonellopsidae
Lynnellidae
Metacylididae
Ptychocylididae
Strobilidiidae
Strombidinopsidae
Tintinnidae
Tintinnidiidae
Xystonellidae
Chromatiaceae
Ectothiorhodospiraceae
Thioalkalispiraceae
Wenzhouxiangellaceae
Woeseiaceae
Chromulinaceae
Dinobryaceae
Paraphysomonadaceae
Chamaesiphonaceae
Chroococcaceae
Cyanobacteriaceae
Dermocarpellaceae
Gloeobacteraceae
Microcystaceae
Xenococcaceae
Chroococcidiopsidaceae
Chytridiaceae
Chytriomycetaceae
Synchytriaceae
Cladophoraceae
Clostridiaceae
Chytriodiniaceae
Calcidiscaceae
Corallinaceae
Lithophyllaceae
Corethraceae
Coriobacteriaceae
Corticiaceae
Corynebacteriaceae
Coscinodiscaceae
Hemidiscaceae
Salpingoecidae
Protaspidae
Hemiselmidaceae
Cyclophoraceae
Mesodiniidae
Cymatosiraceae
Cymbellaceae
Gomphonemataceae
Cystofilobasidiaceae
Bernardetiaceae
Catalimonadaceae
Cyclobacteriaceae
Cytophagaceae
Flammeovirgaceae
Hymenobacteraceae
Microscillaceae
Persicobacteraceae
Reichenbachiellaceae
Dacrymycetaceae
Vexilliferidae
Desulfarculaceae
Desulfobacteraceae
Desulfobulbaceae
Nitrospinaceae
Desulfohalobiaceae
Desulfomicrobiaceae
Desulfovibrionaceae
Desulfuromonadaceae
Geobacteraceae
Dictyochaceae
Dictyotaceae
Amphidomataceae
Dinophysaceae
Dinophysiaceae
Gigasporaceae
Dysteriidae
Hartmannulidae
Plesiotrichopidae
Eccriniidae
Chordariaceae
Ectocarpaceae
Scytosiphonaceae
Acinetidae
Erwiniaceae
Yersiniaceae
Enterobacteriaceae
Ancylistaceae
Entomophthoraceae
Erysipelotrichaceae
Erysiphaceae
Erythrotrichiaceae
Hartmannellidae
Lachnospiraceae
Oscillospiraceae
Peptococcaceae
Peptoniphilaceae
Peptostreptococcaceae
Bodonaceae
Adeleidae
Cryptosporidiidae
Eimeriidae
Sarcocystidae
Euglenaceae
Phacaceae
Paulinellidae
Gregarinidae
Lecudinidae
Monocystidae
Urosporidae
Aspidiscidae
Certesiidae
Euplotidae
Gastrocirrhidae
Uronychiidae
Monodopsidaceae
Astasiaceae
Euzebyaceae
Ephelotidae
Crocinitomicaceae
Cryomorphaceae
Flavobacteriaceae
Weeksellaceae
Fragilariaceae
Sargassaceae
Fusobacteriaceae
Gemmataceae
Glaucocystaceae
Glomeraceae
Goniomonadaceae
Ceratiaceae
Ceratocoryaceae
Goniodomataceae
Gonyaulacaceae
Ostreopsidaceae
Pyrophacaceae
Gracilariaceae
Gymnodiniaceae
Kareniaceae
Polykrikaceae
Ptychodiscaceae
Warnowiaceae
Plasmodiidae
Halobacteroidaceae
Halobacteriaceae
Halorubraceae
Haloplasmataceae
Pterospermataceae
Hapalidiaceae
Didiniidae
Helicoprorodontidae
Lacrymariidae
Sclerotiniaceae
Hemiaulaceae
Peritromidae
Cohaesibacteraceae
Kaistiaceae
Rhizobiaceae
Xanthobacteraceae
Nectriaceae
Immundisolibacteraceae
Isochrysidaceae
Noelaerhabdaceae
Katablepharidaceae
Kiloniellaceae
Kordiimonadaceae
Temperatibacteraceae
Labyrinthulaceae
Carnobacteriaceae
Streptococcaceae
Coxiellaceae
Legionellaceae
Lentisphaeraceae
Leptocylindraceae
Flabellulidae
Massisteriidae
Licmophoraceae
Lithodesmiaceae
Trochamminidae
Spathulosporaceae
Rhodanobacteraceae
Magnetococcaceae
Malasseziaceae
Bathycoccaceae
Mamiellaceae
Marimonadida incertae sedis
Marinilabiliaceae
Stephanopyxidaceae
Methylococcaceae
Brevibacteriaceae
Microbacteriaceae
Micrococcaceae
Discotrichidae
Soritidae
Ophiocytiaceae
Mucoraceae
Rhizopodaceae
Nannocystaceae
Berkeleyaceae
Naviculaceae
Phaeodactylaceae
Pinnulariaceae
Plagiotropidaceae
Pleurosigmataceae
Sellaphoraceae
Chromobacteriaceae
Neisseriaceae
Nemastomataceae
Nephroselmidaceae
Algiphilaceae
Salinisphaeraceae
Sterolibacteriaceae
Nitrosopumilaceae
Kofoidiniaceae
Noctilucaceae
Aphanizomenonaceae
Hapalosiphonaceae
Nostocaceae
Alcanivoracaceae
Balneatrichaceae
Endozoicomonadaceae
Hahellaceae
Halomonadaceae
Kangiellaceae
Litoricolaceae
Oceanospirillaceae
Oleiphilaceae
Saccharospirillaceae
Pseudobacteriovoracaceae
Strombidiidae
Tontoniidae
Oltmannsiellopsidaceae
Oocystaceae
Ophiostomataceae
Microcoleaceae
Oscillatoriaceae
Schizotrichaceae
Oxyrrhinaceae
Bodonidae
Paraliaceae
Parvularculaceae
Pasteurellaceae
Pavlovaceae
Pedinellaceae
Pelagomonadaceae
Frontoniidae
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Heterocapsaceae
Kryptoperidiniaceae
Oxytoxaceae
Peridiniaceae
Pfiesteriaceae
Protoperidiniaceae
Thecadiniaceae
Opisthonectidae
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Peronosporaceae
Peyssonneliaceae
Ascobolaceae
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Phaeocystaceae
Cinetochilidae
Orchitophryidae
Philasteridae
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Phycisphaeraceae
Didymiaceae
Phytodiniaceae
Picomonadidae
Pinguiochrysidaceae
Planctomycetaceae
Plasmodiophoridae
Didymellaceae
Leptosphaeriaceae
Phaeosphaeriaceae
Pleosporaceae
Cyclidiidae
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Plocamiaceae
Phanerochaetaceae
Polyporaceae
Porphyridiaceae
Propionibacteriaceae
Prorocentraceae
Colepidae
Holophryidae
Protoraphidaceae
Chrysochromulinaceae
Prymnesiaceae
Pseudanabaenaceae
Moraxellaceae
Pseudomonadaceae
Pucciniaceae
Puniceicoccaceae
Pyramimonadaceae
Chroomonadaceae
Geminigeraceae
Pyrenomonadaceae
Pyrocystaceae
Rhaphoneidaceae
Aurantimonadaceae
Bradyrhizobiaceae
Hyphomicrobiaceae
Methylobacteriaceae
Methylocystaceae
Phyllobacteriaceae
Rhodobiaceae
Rhizosoleniaceae
Rhodobacteraceae
Rhodochaetaceae
Acetobacteraceae
Rhodospirillaceae
Salinibacteraceae
Champiaceae
Lomentariaceae
Rhodymeniaceae
Anaplasmataceae
Ehrlichiaceae
Rickettsiaceae
Ammoniidae
Anomalinidae
Buliminidae
Calcarinidae
Candeinidae
Globigerinidae
Globorotaliidae
Haynesinidae
Nonionidae
Nummulitidae
Rotaliidae
Metschnikowiaceae
Haliphthoraceae
Lewinellaceae
Saprospiraceae
Sarcinochrysidaceae
Vahlkampfiidae
Vorticellidae
Zoothamniidae
Sneathiellaceae
Sphacelariaceae
Scenedesmaceae
Selenastraceae
Sphingobacteriaceae
Erythrobacteraceae
Sphingomonadaceae
Spirochaetaceae
Spirulinaceae
Striatellaceae
Stylonemataceae
Suessiaceae
Symbiodiniaceae
Surirellaceae
Syndiniaceae
Leptolyngbyaceae
Merismopediaceae
Synechococcaceae
Synergistaceae
Syntrophaceae
Mallomonadaceae
Rhabdosphaeraceae
Syracosphaeraceae
Taphrinaceae
Pseudodifflugiidae
Thalassionemataceae
Catenulaceae
Lauderiaceae
Skeletonemaceae
Stephanodiscaceae
Thalassiosiraceae
Esquamulidae
Thelebolaceae
Thermaceae
Piscirickettsiaceae
Thiotrichaceae
Aplanochytriidae
Thraustochytriaceae
Tovelliaceae
Toxariaceae
Botryococcaceae
Trebouxiaceae
Sistotremataceae
Bulleribasidiaceae
Triceratiaceae
Lyophyllaceae
Trypanosomatidae
Phaeophilaceae
Ulvaceae
Coleosporiaceae
Ustilaginaceae
Vannellidae
Verrucomicrobiaceae
Vibrionaceae
Chlamydomonadaceae
Phacotaceae
Xanthomonadaceae
Nom scientifique
CD_NOM
Règne
Classe
Ordre
Famille
Date première observation
Date dernière observation
Fiche
Chiffres clés :
85762 données
328 espèces
328 taxons
Répartition des données par groupes taxonomiques :
Groupes vernaculaires de premier ordre
Groupes vernaculaires de second ordre
Répartition temporelle: