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Le site occupe un tronçon du lit majeur de la Loire. Les milieux alluviaux variés (bancs d’alluvions, bras morts, lit du fleuve) sont encadrés par de la prairie bocagère encore bien conservée. La Loire, cours d’eau très dynamique, est caractérisé par une large bande de divagation de son cours et par des successions de zones d’érosions et de dépôts d’alluvions à l'origine de biotopes variés. Les bras morts sont riches en habitats humides. Sur les terrasses en rive droite se trouve un ensemble dunaire ainsi qu’une mince bande de coteau que la Loire a taillé dans les marnes et les argiles du Bourbonnais.
Ce site est d’intérêt régional pour ses habitats alluviaux, sa faune et sa flore.
Le cours du fleuve et ses abords présentent divers habitats dont :
- des herbiers aquatiques des eaux courantes, d’intérêt européen,
- des végétations pionnières amphibies des bordures de points d’eau, d’intérêt européen,
- des végétations sur dépôts sableux, d’intérêt régional,
- des végétations sur dépôts limoneux, d’intérêt européen,
- des petites roselières au niveau des bras morts et dépressions inondables,
- des saulaies pionnières riveraines,
- des forêts alluviales à frênes, ormes, peupliers et saules, habitats d’intérêt européen,
- des pelouses dunaires, d’intérêt européen,
- des pelouses sur alluvions calcaréo-siliceuses (alliances végétales du Sileno conicae-Cerastion semidecandri et de l’Armerienion elongatae), d’intérêt européen.
Les pelouses sèches accueillent un cortège varié d’espèces végétales déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF avec :
- l'Astérocarpe blanchâtre (Sesamoides purpurascens), plante protégée réglementairement et exceptionnelle en Bourgogne,
- la Renoncule de Montpellier (Ranunculus monspeliacus), plante méditerranéenne rarissime en Bourgogne,
- la Spargoute de Morison (Spergula morisonii), plante annuelle naine rare en Bourgogne et protégée réglementairement,
- le Corynéphore blanchâtre (Corynephorus canescens), plante protégée réglementairement et rare en Bourgogne,
- le Myosotis de Balbis (Myosotis balbisiana), plante exceptionnelle en Bourgogne, inscrite au livre rouge de la flore menacée de France,
- le Trèfle souterrain (Trifolium subterraneum), plante naine protégée réglementairement.
Le corridor ligérien constitue une zone de nidification majeure pour des oiseaux déterminants pour l’inventaire ZNIEFF comme :
- la Sterne pierregarin (Sterna hirundo) et la Sterne naine (Sternula albifrons), oiseau d’eau d’intérêt européen, nicheur rare en Bourgogne, sensible au dérangement sur ses sites de reproduction (bancs de graviers) et aux modifications du régime fluvial,
- l'Aigrette garzette (Egretta garzetta), échassier d'intérêt européen, nicheur rare en Bourgogne,
- l'Oedicnème criard (Burhinus oedicnemus), oiseau d’intérêt européen,
- le Guêpier d’Europe (Merops apiaster),
- le Petit Gravelot (Charadrius dubius).
Le Val de Loire constitue également un corridor écologique majeur en période de halte migratoire pour divers oiseaux d’eau comme le Chevalier gambette (Tringa totanus).
Ce patrimoine dépend essentiellement du maintien de la dynamique naturelle du fleuve.
Il convient d'éviter les extractions de matériaux dans le lit majeur, ainsi que la création de digues et le remblaiement.
Une agriculture extensive (pâturage extensif, absence de retournement des prairies) est importante dans le bassin d’inondation.
Périmètre délimité par la partie Bourguignonne du lit majeur de la Loire avec, à l'est, la terrasse sableuse et le coteau pentu de Saint-Aubin.
