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Le site occupe le tronçon du val d’Allier le plus en amont en Bourgogne. Des grèves sableuses y alternent avec des méandres abandonnés, des forêts riveraines bien structurées et des îlots de graviers régulièrement remaniés. Le cours d’eau, très dynamique, est caractérisé par des successions de zones d’érosions et de dépôts d’alluvions, ce qui crée des biotopes variés. Les bras morts et leurs abords présentent différents types d’habitats humides (boires, mares, ripisylves, roselières, cariçaies, prairies inondables, etc. Ces milieux sont encadrés par des prairies bocagères alternant avec des secteurs cultivés ou plantés en peupliers.
Ce site est d’intérêt régional pour ses habitats alluviaux, sa faune et sa flore.
Le cours de l’Allier et ses abords présentent divers habitats avec :
- des herbiers aquatiques des cours d’eau, d’intérêt européen,
- des végétations sur dépôts sableux, d’intérêt régional,
- des végétations sur dépôts limoneux, d’intérêt européen,
- des saulaies pionnières riveraines,
- des herbiers aquatiques des plans d’eau, d’intérêt européen,
- des végétations amphibies des berges exondées des plans d’eau, d’intérêt européen,
- des roselières et cariçaies,
- des prairies humides inondables de fauche, d’intérêt régional,
- des mégaphorbiaies, d’intérêt européen,
- des prairies de fauche, d’intérêt européen,
- des forêts alluviales à frênes, ormes et saules, d’intérêt européen.
Dans ces biotopes, diverses espèces végétales déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF sont présentes, notamment :
- la Lathrée clandestine (Lathrea clandestina), plante des forêt alluviales, exceptionnelle en Bourgogne et en limite nord-est de son aire de répartition,
- la Gratiole officinale (Gratiola officinalis), plante protégée réglementairement, inscrite au livre rouge de la flore menacée de France,
- l'Oenanthe à feuilles de silaüs (Oenanthe silaifolia), plante protégée réglementairement,
- la Pulicaire vulgaire (Pulicaria vulgaris), plante protégée réglementairement et inscrite au livre rouge de la flore menacée de France,
- le butome en ombelle (Butomus umbellatus), plante protégée réglementairement,
- la Véronique à feuilles d'acinos (Veronica acinifolia), plante très rare et localisée en Bourgogne, inscrite au livre rouge de la flore menacée de France.
Localement, ont été observées :
- des pelouses ouvertes sur sables acides, d’intérêt régional,
- des pelouses sur alluvions calcaréo-siliceuses (alliance végétale de l’Armerienion elongatae), d’intérêt européen.
Ces milieux sont caractérisés par plusieurs espèces végétales déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF comme :
- l'Armoise champêtre (Artemisia campestris), plante rarissime en Bourgogne et protégée réglementairement,
- la Renoncule des marais (Ranunculus paludosus), plante méditerranéenne annuelle des pelouses sèches, rare et très localisée en Bourgogne,
- la Vesce printanière (Vicia lathyroides), plante annuelle naine très rare en Bourgogne,
- le Corynéphore blanchâtre (Corynephorus canescens), plante protégée réglementairement, peu commune en Bourgogne,
- la Spargoute de Morison (Spergula morisonii), plante annuelle naine rare en Bourgogne et protégée réglementairement,
- le Trèfle souterrain (Trifolium subterraneum), plante naine protégée réglementairement.
Les berges sableuses exondées constituent des sites de nidification pour la Sterne pierregarin (Sterna hirundo) et la Sterne naine (Sternula albifrons), deux oiseaux d’eau d’intérêt européen, nicheurs rares à très rares en Bourgogne, sensibles au dérangement sur leurs sites de reproduction (bancs de graviers) et aux modifications du régime fluvial. L’Allier et ses proches abords accueillent également l’Oedicnème criard (Burhinus oedicnemus), oiseau d’intérêt européen.
D’autres espèces nidifient préférentiellement dans le système prairial bocager, comme:
- la Pie-grièche écorcheur (Lanius collurio), passereau chasseur d’insectes, d’intérêt européen,
- l'Alouette lulu (Lullula arborea), passereau d’intérêt européen,
- la Huppe fasciée (Upupa epops).
Le lit de l’Allier constitue aussi un corridor écologique pour les poissons migrateurs comme la Lamproie marine (Petromyzon marinus), l'Alose (Alosa alosa) et le Saumon de l’Atlantique (Salmo salar), trois poissons d’intérêt européen, sensibles aux pollutions et aux dégradations du lit des cours d'eau (ouvrage d'arts, extractions de matériaux).
Au niveau des berges du fleuve un cortège d’insectes déterminants pour l’inventaire ZNIEFF a été répertorié avec entre autres :
- le Gomphe à pattes jaunes (Gomphus flavipes) et le Gomphe serpentin (Ophiogomphus cecilia), deux libellules d’intérêt européen,
- le Gomphe semblable (Gomphus simillimus).
Enfin, le Castor (Castor fiber), mammifère d’intérêt européen, est bien implanté sur l’Allier.
D’anciennes mines de Kaolin, à Livry, accueillent en période d'hibernation deux espèces de chauves-souris d’intérêt européen :
- le Petit Rhinolophe (Rhinolophus hipposideros),
- le Grand Rhinolophe (Rhinolophus ferrumequinum).
Ce patrimoine dépend essentiellement du maintien de la dynamique naturelle du cours d’eau. Il convient d'éviter les extractions de matériaux dans le lit majeur, la création de digues et le remblaiement.
Une agriculture extensive (pâturage extensif, absence de retournement des prairies) est également importante.
Zone délimitée à l'ouest et au sud par les limites départementales respectives du Cher et de l'Allier, au nord au niveau du pont du Veurdre et à l'est avec les routes D134, D22, D272 et D189. Les enveloppes est prennent en compte l'enveloppe de crue centennale.
