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L'amont du réseau hydrographique de la Leyre est caractérisé par des vallées étroites bordées de terrains en pente forte. De nombreuses petites tourbières et zones tourbeuses se sont développées sur les pentes ou dans des fonds humides. En complément, une part importante des terrains en pente forte est colonisée par des milieux secs, landes ou boisements de chênes tauzins.
La ZNIEFF comprend également trois gîtes estivaux de murins à oreilles échancrées et de grands rhinolophes, sur les communes d'Argelouse et de Moustey (ponts et vieille bâtisse). La ripisylve et les boisements de feuillus des vallées entre ces 3 gîtes, 10 km à l'amont et 10 km à l'aval ont également été intégrés dans la ZNIEFF de type I en tant qu'habitats favorables (chasse).
Les tourbières accueillent des plantes rares et/ou protégées et sont fréquentées par quelques espèces de l'entomofaune, comme le fadet des laîches sur les landes tourbeuses ou la leucorrhine à front blanc dans les mares oligotrophes des tourbières.
La principale menace sur cette ZNIEFF résulte d'éventuels drainages pour développer les plantations de pins maritimes. Toutefois, ces opérations coûteuses ne menacent que des terrains ayant déjà fortement évolué vers un assèchement naturel.
