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Malgré les dégradations dues à au développement de la zone urbanisée de La Brède, le Saucats est un cours d'eau globalement de bonne qualité dont le lit mineur et surtout les milieux rivulaires accueillent une faune et une flore diversifiées incluant de nombreuses espèces rares et/ou protégées.
Quelques tronçons du Saucats et du Brousteyrot font partie de la réserve naturelle géologique de Saucats. Cette dernière, outre les nombreux fossiles qu'elle abrite, constitue aussi une référence mondiale qui expose les stratotypes de l'Aquitanien et du Burdigalien (le stratotype d’une unité stratigraphique, donc d'un étage géologique, est une coupe-type qui sert d'étalon pour la définition et l'identification de l'unité).
Certains de ces affleurements rivulaires présentent des suintements carbonés colonisés par des bryophytes du genre Cratoneuron, formant un habitat naturel rare et vulnérable.
