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Le Bugey, situé sur le côté est du département de l'Ain, constitue la partie méridionale du massif du Jura. Les précipitations sont particulièrement abondantes dans cette région puisqu'on relève souvent plus de 1500 mm sur l'année. Toutefois la présence d'un relief karstique particulièrement marqué explique la circulation surtout souterraine de l'eau. C’est pourquoi les zones humides sont si remarquables. La combe de Léchaud, entre la cluse de Nantua et le plateau d'Hauteville, est un synclinal résultant des soulèvements géologiques tertiaires de ce substrat calcaire formé au secondaire. L'abondance des précipitations a favorisé l'installation, sur les replats, de plusieurs tourbières. Celles-ci occupent au total près de 10 % de la surface de la combe de Léchaud. Le marais des Gruyères appartient aux tourbières dites mixtes. Ce type de tourbière correspond initialement à des tourbières alcalines qui évoluent progressivement vers des tourbières acides. Des sphaignes s’installent dans les secteurs les moins soumis aux écoulements carbonatés, et forment progressivement des buttes déconnectées de l’écoulement sous-jacent. Le marais des Gruyères présente un haut-marais boisé avec en périphérie des prairies humides à Molinie bleue et des "bas-marais" (marais tout ou partie alimentés par la nappe phréatique) à Laîche de Daval . Les tourbières mixtes représentent 7% de la surface des tourbières de la région. La forte amplitude de pH explique la juxtaposition de la flore des tourbières alcalines et de celle des tourbières acides. La Swertie vivace et le Scirpe de Hudson sont deux des plantes remarquables du marais des Gruyères. Si la première se rencontre plutôt dans les "bas-marais", le second indique des milieux à acidité moyenne ("hauts-marais", marais mixtes).
