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Le massif du Bas-Bugey est une région d’une très grande richesse biologique. A l'écart des principales voies de communication, il reste bien préservé. Mais c'est sa physionomie qui présente le plus d'intérêt. De la plaine du Rhône au sommet du massif (Molard Dedon, 1219 m), le dénivelé est de près de 1000 m. Les conditions climatiques rencontrées sur l'ensemble du massif sont particulièrement variées et permettent une grande diversité botanique. Les milieux rencontrés sont aussi divers que tourbières, lacs, forêts montagnardes, pelouses sèches, pâturages, falaises... Le marais de Chatonod est occupé par des boisements humides d’Aulne glutineux et des peuplements de hautes herbes de prairies humides. La végétation herbacée y est luxuriante, de par la richesse chimique et la très bonne alimentation en eau du sol. Au contact des milieux terrestres et aquatiques, les boisements d’Aulne glutineux forment des habitats naturels à intérêt écologique majeur, notamment en tant que refuge d’espèces diverses. Deux espèces botaniques y présentent un intérêt particulier. On rencontre le Peucédan des marais, une grande ombellifère qui peut atteindre un mètre de haut et caractéristique de ces milieux humides. La Laîche paradoxale (ou Laîche à épis rapprochés) était une espèce relativement commune au siècle dernier, qui a connu depuis lors une forte régression due à la destruction de son habitat ; elle reste présente au marais de Chatonod.
