La ZNIEFF « Gorges de la Vis », d'une superficie de 2882 hectares, se trouve pour moitié dans le Gard et pour moitié dans l'Hérault. La rivière de la Vis s'y écoule dans un canyon qui sépare les Causses du Larzac à l'ouest et celui de Blandas au nord-est. Au sud-est, ces gorges sont adossées au massif calcaire de la Séranne. Profonde de 300 mètres environ, large d'environ 1 kilomètre, la ZNIEFF s'étend sur un peu plus de 20 kilomètres de long. Vissec, Navacelles, Madières et Gorniès sont les principaux lieux habités inclus dans le périmètre. Ils sont desservies par des routes départementales qui traversent les gorges et laissent de grands espaces qui ne sont accessibles que par des sentiers à l'ouest de la zone ou, à l'est, par une route départementale qui longe la rivière jusqu'à la confluence avec le fleuve Hérault. Le canyon est surplombé par des falaises calcaires sous lesquelles de vastes éboulis, parfois colonisés par la végétation, tombent jusqu'à la Vis. Cette dernière, souterraine depuis les environs d'Alzon (en amont de la ZNIEFF), réapparaît au niveau de la résurgence de la Foux à l'ouest du périmètre.
A partir du village de Vissec, le périmètre part vers l'aval de la rivière en longeant, côté gardois et côté héraultais, les ruptures de pentes des Gorges de la Vis. A partir de Gorniès, là où le relief s'apparente moins à un canyon, les limites épousent la plus grande partie de la vallée jusqu'à la confluence avec le fleuve Hérault.