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La ZNIEFF « Cours amont de la rivière de la Vernassonne » se trouve dans le massif de la Montagne Noire, au nord du département de l'Aude. Elle est constituée par un linéaire de près de 4 kilomètres de la rivière de la Vernassonne en amont du village de Saissac et comprend l'aval de ses affluents. Le territoire concerné occupe une superficie de 30 hectares situés entre 470 et 570 mètres d'altitude.
La délimitation de la ZNIEFF est marquée à l'amont par le sentier traversant la rivière en amont du lieu-dit la Rouge et en aval par le Pont de l'Horte, à l'entrée orientale du village de Saissac.
De part et d'autre du cours d'eau, le périmètre englobe les zones humides riveraines (ripisylves et praries) ainsi que les portions aval des affluents de la Vernassonne.
