Typologie nationale des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l'Atlantique (NatHab-Atl)
Date de mise à jour du jeu de données
01/03/2019
Auteurs de la typologie
Noëmie Michez (UMS 2006 PATRINAT), Annabelle Aish (MNHN-SPN), Ann C. Andersen (ABICE/UMR 7144/ Sorbonne Université), Erwan Ar Gall (LEMAR/UMR 6539/IUEM), Alexandrine Baffreau (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Touria Bajjouk (LEBCO/DYNECO/IFREMER), Hugues Blanchet (EPOC/UMR 5805/Université de Bordeaux), Pauline Cajeri (LIENSs/UMR 7266/Université de La Rochelle), Pauline Chauvet (LEP/EEP/IFREMER), Jean-Claude Dauvin (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Dominique Davoult (EFEB/UMR 7144/ Sorbonne Université), Thibaut de Bettignies (UMS 2006 PATRINAT), Marie-Noëlle de Casamajor (LRHAQ/IFREMER), Sandrine Derrien-Courtel (Station de Biologie Marine de Concarneau/MNHN), Stanislas Dubois (LEBCO/DYNECO/IFREMER), Marie-Claire Fabri (LERPAC/LITTORAL/IFREMER), Aurélie Foveau (FBN/LELRA/IFREMER), Franck Gentil (DIVCO/UMR 7144/ Sorbonne Université), Brigitte Guillaumont (LEP/EEP/IFREMER), Jacques Grall (UMS 3113/IUEM/UBO), Christian Hily (LEMAR/CNRS/IUEM/UBO), Céline Houbin (Station Biologique de Roscoff/OSU), Anne-Laure Janson (UMS 2006 PATRINAT), Marie La Rivière (UMS 2006 PATRINAT), Laurent Lévèque (Station Biologique de Roscoff/OSU), Line Le Gall (ISYEB/UMR 7205/MNHN), Sophie Lozach (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Lénaick Menot (LEP/EEP/IFREMER), Josiane Popovsky (IMA), Céline Rolet (LOG/UMR 8187/Université Lille 1), Thierry Ruellet (GEMEL), Pierre-Guy Sauriau (LIENSs/UMR 7266/Université de La Rochelle), Nathalie Simon (AD2M/UMR 7144/Sorbonne Université), Laurent Soulier (IMA), Eric Thiébaut (DIVCO/UMR 7144/ Sorbonne Université), Julie Tourolle (LEP/EEP/IFREMER), Inge Van den Beld (LEP/EEP/IFREMER)
Auteurs de la table
PatriNat
Territoire(s) concerné(s)
Manche, Mer du Nord et Atlantique français
Organisme responsable
PatriNat
Langue d'origine des données
FR
Contexte
Compte tenu de l’intérêt grandissant des politiques publiques pour le milieu marin et de l’actualité chargée des différents programmes de gestion, de conservation ou d’inventaire (inventaires ZNIEFF, inventaire biologique et analyse écologique des habitats marins patrimoniaux des sites N2000 et des PNM, Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin, Système d’Information sur la Nature et le Paysage), le besoin de cohérence est élevé. Le développement de ces programmes nécessite la mise en place et l’utilisation d’outils tels que les référentiels. Ils permettent de définir un langage commun ainsi que les unités de travail. Parmi ces référentiels, il existe plusieurs classifications des habitats benthiques. Créées dans des contextes particuliers, elles répondent à des objectifs donnés, soit de connaissance et d’inventaire comme la typologie des ZNIEFF-Mer (Dauvin et al., 1994), soit de gestion et de conservation comme la typologie des habitats d’intérêt communautaire de l’Union Européenne (European Commission, 2007). Ces outils, adaptés à leur problématique, se rapportent à des échelles différentes : européenne pour Natura 2000 et EUNIS, nationale ou régionale pour les ZNIEFF. Il était nécessaire d’homogénéiser et d’harmoniser ces référentiels existants. Pour cela un nouveau référentiel national des habitats marins benthiques a été créé en synthétisant cet existant et en le complétant. Il est composé de deux typologies : une relative aux biocénoses de Méditerranée et l’autre concernant les habitats de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Son utilisation est préconisée pour l’ensemble des programmes ayant trait à la conservation des habitats marins à l’échelle nationale.
Description du travail
Cette typologie sert de référence à l’échelle nationale pour les habitats marins benthiques présents en Manche, en Mer du Nord et en Atlantique.
Sa première version, parue en 2013 (rapport explicatif Michez et al., 2013), était intégralement basée sur la proposition de typologie du REBENT (Guillaumont et al., 2008 et Bajjouk et al., 2011) à laquelle des habitats identifiés dans la bibliographie ou émanant de la communauté scientifique avaient été intégrés ainsi que certains habitats de la classification EUNIS (2008). Elle contenait 458 unités réparties en 7 niveaux. Suite à l’acquisition de nouvelles informations sur les habitats marins benthiques, une mise à jour de la typologie était nécessaire pour qu’elle soit le reflet des connaissances actuelles et a abouti à une deuxième version parue en 2015 (rapport explicatif Michez et al., 2015). Elle incluait 565 unités réparties en 6 niveaux. La version actuelle, la version 3, est parue en 2019 (rapport explicatif Michez et al., 2019). Elle comporte 664 unités hiérarchisées selon 5 niveaux. Par rapport à la version 2, le premier niveau hiérarchique a entièrement été modifié par soucis de cohérence avec la mise à jour d’EUNIS. Il se compose de 28 unités qui sont des combinaisons d’un étage et d’un type de substrat (par exemple les roches infralittorales). De nouveaux habitats ont été ajoutés, la codification a été totalement revisitée et la terminologie a été homogénéisée.
La collaboration de nombreux experts benthologues a été primordiale pour l'établissement et la consolidation de ce référentiel.
Origine du jeu de données
Fichier créé par Noëmie Michez et mis à jour par Marie La Rivière, Juliette Delavenne et Salomé Andres (PatriNat)
Références bibliographiques
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Référencement
PatriNat, 2023. Table de la typologie nationale des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l'Atlantique (NatHab-Atl). Base de données HabRef v7.
Dernière modification
Depuis la version 5.0 d'HABREF (novembre 2019), modifications de la version 3 de la typologie incluses dans la version 7.0 d'HABREF : 108 fiches descriptives complètes ont été ajoutées pour toutes les unités de niveau 2 et certains champs descriptifs ont été remplis pour 320 fiches de niveau 3 ou 4. Le libellé de 10 unités a été modifié (5 pour tenir compte de l'évolution de la taxonomie et 5 pour clarifier le cadre de l'unité). Une unité de niveau 3 a été supprimée et les 2 unités de niveau 4 qu'elle incluait ont été déplacées. Le statut de présence en France de 22 unités a été modifié en incertain (à confirmer).
Version 3 de la typologie incluse dans la version 5.0 d’HABREF, pour plus d’explications sur les modifications opérées dans cette version de la typologie se reporter au rapport : Michez N., Thiébaut E., Dubois S., Le Gall L., Dauvin J.C., Andersen A. C., Baffreau A., Bajjouk T., Blanchet H., de Bettignies T., de Casamajor M.-N., Derrien-Courtel S., Houbin C., Janson A.L., La Rivière M., Lévèque L., Menot L., Sauriau P.G., Simon N., Viard F., 2019. Typologie des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Version 3. UMS PatriNat, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, 52 p.
Source de l'ajout à la typologie
L’habitat A5-7 Herbiers à Zostera marina sur sables médiolittoraux a été ajouté dans la version 3 de la typologie (Michez et al., 2019) sur les recommandations de J.-C. Dauvin et de E. Thiébaut en 2019. Les herbiers de Zostera marina étaient présents dès la première version de la typologie (Michez et al., 2013), sans distinction de substrat ou d’étage, dans la catégorie des habitats particuliers sous le code P01.02 Herbiers à Zostera marina. Cet habitat a par la suite été supprimé dans la version 3 de la typologie et remplacé par quatre habitats distinguant les herbiers de Zostera marina selon leur substrat et leur étage :
- A3-4 Herbier à Zostera marina sur sédiments grossiers médiolittoraux
- A5-7 Herbiers à Zostera marina sur sables médiolittoraux
- B4-4 Herbiers à Zostera marina sur sédiments hétérogènes infralittoraux
- B5-5 Herbiers à Zostera marina sur sables infralittoraux
Facteurs abiotiques
Etage : Médiolittoral
Nature du substrat : Sables
Répartition bathymétrique : >0m
Hydrodynamisme : Faible
Salinité : Milieu marin ; [peut tolérer une légère dessalure à l’embouchure des estuaires]
Température : Variable
Lumière : Système phytal
Régime trophique : Mésotrophe
Caractéristiques stationnelles
L’habitat A5-7 constitue des herbiers de taille variable sur substrat sableux du médiolittoral inférieur. L’herbier est formé par la zostère marine Zostera marina qui est caractérisée par des feuilles de quelques centimètres à plus d’un mètre de long (un maximum de 2m10 a été mesuré sur l’archipel de Molène) et de largeur moyenne (entre 5 et 12mm ; Cabioc’h et al., 2014). Du fait du caractère intertidal de cet habitat, les zostères marines sont soumises à l’alternance de phases d’émersion et d’immersion. En réponse à ce stress environnemental, Zostera marina est présente sous la forme parvozostérique ce qui se traduit par des feuilles un peu plus étroites et un peu plus courtes qu’en milieu subtidal (Den Hartog, 1967 ; Nebout et al., 2002).
L’habitat A5-7 constitue un habitat à forte valeur écologique et patrimoniale qui abrite une faune très riche et très diversifiée.
Variabilité
Plusieurs paramètres concernant l’habitat A5-7 peuvent varier entre deux sites. La densité de pieds de zostères marines au sein de l’herbier peut considérablement varier entre les sites, certains présentant des herbiers très denses (près de 1000 pieds par m²) tandis que d’autres sont caractérisés par des densités de zostères plus faibles (entre 100 et 200 pieds par m²). Le seuil retenu par les affaires maritimes et au deçà duquel on considère que l’herbier perd son rôle ingénieur est 50 pieds par m².
L’emprise spatiale des herbiers varie entre les sites selon les conditions environnementales (dynamique sédimentaire, hydrodynamisme, lumière). L’hydrodynamisme a également une forte influence sur la taille des pieds de zostères, sur leur densité mais aussi sur la biodiversité associée et sa dynamique. La concentration en nutriments influencera la quantité d’épiphytes présentes sur les feuilles de Z. marina.
Les herbiers peuvent prendre la forme de larges prairies de superficie importante ou bien à l’inverse de tâches plus ou moins isolées et de taille variable. Les herbiers sur sables présentent le plus souvent des bords d’attaque naturels, c’est-à-dire des bandes sableuses qui entrecoupent l’herbier (à la manière de « ripple-marks » dans les milieux subtidaux) et qui sont formées de manière naturelle par le clapot de l’eau. Cela se traduit par l’export de matériel sédimentaire (sables) de la base de l’herbier vers l’arrière, formant ainsi un banc de sable de taille variable et pouvant entraîner la perte de pieds d’herbiers par déchaussement. Cela est particulièrement visible aux Glénan.
Communautés ou espèces caractéristiques
L’espèce caractéristique de cet habitat est la zostère marine Zostera marina.
Espèces associées
Plusieurs centaines d’espèces ont à ce jour été répertoriées au sein des herbiers de zostères marines, y compris sur les herbiers constituant l’habitat A5-7. Par conséquent, la liste d’espèces associées à cette fiche ne constitue pas une liste exhaustive et présente seulement quelques-unes des espèces les plus communément observées dans cet habitat.
La biocénose de cet habitat se compose d’annélides (ex : Platynereis dumerilii, Euclymene oerstedi, Notomastus latericeus, Spio martinensis), de quelques bivalves (ex : Kurtiella bidentata, Loripes orbiculatus), d’un nombre important de crustacés (ex : Ampithoe spp., Apherusa spp., Ericthonius spp., Idotea spp., Gammarus spp., Lysianassa spp. etc…) et de gastéropodes (ex : Jujubinus striatus, Rissoa parva, Steromphala spp., Tritia reticulata). Des espèces de syngnathes (ex : Syngnathus acus, Syngnathus typhle), d’hippocampes (ex : Hippocampus guttulatus) et de gobies (ex : Gobiusculus flavescens) occupent également cet habitat quoique leur observation ne soit pas systématique.
L’habitat A5-7 abrite de nombreuses espèces protégées (liste rouge UICN mondiale, européenne et régionale, Convention de Berne, Convention OSPAR) ainsi qu’un grand nombre d’espèces patrimoniales et déterminantes ZNIEFF (cf. liste associée).
Dynamique temporelle
La partie inférieure de l’habitat peut parfois être recouverte par des sables mobiles, entraînant ainsi la disparition de l’herbier. Si les conditions hydrodynamiques changent, l’herbier peut néanmoins se rétablir lorsque les conditions lui sont de nouveau favorables. Il peut donc y avoir une forte variabilité interannuelle en terme de surface de l’herbier.
En milieu intertidal, Zostera marina peut se développer sous forme annuelle et perdre ses feuilles en hiver. C’est notamment le cas dans le Golfe du Morbihan (Maheo & Denis, 1987). Des variations saisonnières de densité et de longueur de feuilles de zostères existent également dans les herbiers de zostères marines, quel que soit leur substrat.
Sa position médiolittorale expose cet habitat à des variations journalières importantes en termes de température et d’exposition à la lumière. Lors des marées basses, l’herbier est en contact direct avec l’air. Une exposition prolongée à de fortes températures peut impacter de manière significative la survie des pieds de Zostera marina (Davison & Hughes, 1998). A l’automne, de nombreux débris de macroalgues peuvent être présents dans les herbiers.
Les bords d’attaque mentionnés dans la partie précédente ont une dynamique temporelle qui leur est propre. Les bancs sableux formés peuvent ainsi se déplacer dans le temps sur l’herbier mais cela reste un phénomène tout à fait naturel qui n’est pas le signe d’un déclin de l’habitat.
Habitats pouvant être associés ou en contact
L’habitat A5-7 peut potentiellement être en contact avec les habitats de sables fins, les sables fins envasés et les sables grossiers pour l’essentiel (liste non-exhaustive) :
- A3-2 Sédiments grossiers propres médiolittoraux : contact de même niveau, mosaïque possible
- A3-4 Herbiers à Zostera marina sur sédiments grossiers médiolittoraux : contact de même niveau, mosaïque possible
- A5-2 Sables médiolittoraux mobiles : contact de même niveau, mosaïque possible
- A5-3 Sables fins médiolittoraux : contact de même niveau, mosaïque possible
- A5-4 Sables fins envasés médiolittoraux : contact de même niveau, mosaïque possible
- A5-6 Herbiers à Zostera noltei sur sables médiolittoraux : contact de même niveau, mosaïque possible
- B3-2 Sables grossiers et graviers infralittoraux : continuité bathymétrique, contact inférieur
- B4-4 Herbiers à Zostera marina sur sédiments hétérogènes infralittoraux : continuité bathymétrique, contact inférieur
- B5-5 Herbiers à Zostera marina sur sables infralittoraux : continuité bathymétrique, contact inférieur
De manière plus anecdotique, cet habitat peut parfois être observé en contact avec des habitats rocheux :
- A1-2 Roches ou blocs médiolittoraux à dominance algale : contact de même niveau, mosaïque possible
- A1-8 Champs de blocs médiolittoraux : contact de même niveau, mosaïque possible
- B1-2 Champs de blocs de la frange infralittorale : continuité bathymétrique, contact inférieur
Confusions possibles
L’habitat A5-7 peut potentiellement être confondu avec l’habitat A3-4 Herbiers à Zostera marina sur sédiments grossiers médiolittoraux qui peut être présent en continuité directe de l’habitat A5-7. Une analyse granulométrique doit permettre de distinguer ces deux habitats.
L’habitat peut également être confondu avec les herbiers à Zostera noltei sur sables médiolittoraux (A5-6) mais une identification taxonomique précise des pieds de zostère permettra de différencier les deux habitats.
Répartition géographique
De manière générale, les herbiers de zostères, dont Zostera marina, sont présents sur les côtes de la Manche-Atlantique, du Cotentin au bassin d’Arcachon. Peu d’études décrivent la répartition de l’habitat A5-7 en particulier. Il est présent dans le golfe Normand-Breton et sur les côtes bretonnes, notamment au niveau de Saint-Malo, du Trégor et du nord du Léon (abers). Cet habitat semble être également bien représenté en Iroise et aux Glénan. Des herbiers sur sédiments fins sont présents dans le Golfe du Morbihan (Urien et al., 2015). Il est probable que cet habitat soit présent dans d’autres sites entre le Cotentin et le bassin d’Arcachon qui ne soient pas cités dans cette fiche par manque de littérature dédiée.
Fonctions écologiques
Les herbiers de zostères de manière générale et donc l’habitat A5-7 ont un rôle écologique et fonctionnel important. Ils possèdent d’importantes fonctions écologiques et offrent de nombreux services écosystémiques présentés ci-après (Tullrot, 2009 ; Hily, 2010 ; Angst et al., 2014 ; Bajjouk et al., 2015b).
Les herbiers de zostères atténuent l’hydrodynamisme ce qui favorise la sédimentation des particules sédimentaires et diminue la remise en suspension et l’érosion. Couplé à l’important réseau que forment les racines et les rhizomes des zostères, cela permet la stabilisation des sédiments. Les herbiers de zostères ont également un rôle dans la clarification de la colonne d’eau en abritant des organismes filtreurs en abondance. Les pieds de zostères tendent à retenir les débris de macroalgues à la dérive mais également les débris issus des zostères. Cela enrichit les sédiments en matière organique particulaire ce qui stimule l’activité bactérienne. Les herbiers de zostères ont également un rôle dans le cycle biogéochimique de nombreux éléments (azote, phosphore, oxygène, carbone) et agissent comme des puits de carbone très important (leur part est estimée à près d’un cinquième du captage océanique total de carbone à l’échelle mondiale ; Röhr et al., 2016).
Les zostères, et donc Zostera marina, sont des espèces ingénieures qui structurent la biocénose benthique grâce à leur structure complexe et qui abritent de nombreuses espèces absentes des sédiments non végétalisés à proximité. Cet habitat a également un important rôle de zone de reproduction pour les juvéniles de poissons, de crustacés (ex : l’araignée de mer Maja brachydactyla) et de mollusques et de réservoirs de nourriture pour certains poissons (bars, labridés) et oiseaux hivernants qui se nourrissent de la faune associée. Les herbiers de zostères marines ont également un rôle de source de nourriture pour de nombreux anatidés (oies, bernaches, cygnes etc…) qui se nourrissent des feuilles de zostères et dont la présence de cet habitat est essentielle pour les espèces migratrices (Ganter, 2000).
Statut de conservation
Les herbiers de zostères marines au sens large sont classés parmi les espèces menacées et sont protégée par la Convention de Berne (Méditerranée), par la Loi Littoral (France) et sont listés par la Convention OSPAR comme habitat menacé et/ou en déclin. Au titre de la DHFF (92/43/CEE), cet habitat est inclus dans l’Habitat d’Intérêt Communautaire (HIC) 1140 « Replats boueux ou sableux exondés à marée basse ». Il peut également correspondre à l’HIC 1130 « Estuaires » ou l’HIC 1150 « Lagunes côtières » sous réserve de respect des critères d'identification géomorphologiques et de délimitation physiographiques de l'HIC.
Par ailleurs, l’habitat A5-7 abrite de nombreuses espèces protégées (liste rouge UICN mondiale, européenne et régionale, Convention de Berne, Convention OSPAR) ainsi qu’un grand nombre d’espèces patrimoniales et déterminantes ZNIEFF (cf. liste associée).
Tendance évolutive
Selon les variations des conditions hydrodynamiques, l’herbier peut subir un ensablement ou au contraire un déchaussement (Ifremer, 2005) ce qui peut menacer sa pérennité.
Une tendance à la recolonisation suite à la période de « wasting disease » des années 1930 a été notée par Godet et al. (2008, 2009) avec notamment une expansion des herbiers en intertidal.
Auteur(s)
Tauran A., Grall J.
Date de rédaction
2020
Bibliographie
Michez N., Thiébaut E., Dubois S., Le Gall L., Dauvin J.C., Andersen A. C., Baffreau A., Bajjouk T., Blanchet H., de Bettignies T., de Casamajor M.-N., Derrien-Courtel S., Houbin C., Janson A.L., La Rivière M., Lévèque L., Menot L., Sauriau P.G., Simon N., Viard F., 2019. Typologie des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Version 3. UMS PatriNat, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, 52 p. (Source)
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