Typologie nationale des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l'Atlantique (NatHab-Atl)
Date de mise à jour du jeu de données
01/03/2019
Auteurs de la typologie
Noëmie Michez (UMS 2006 PATRINAT), Annabelle Aish (MNHN-SPN), Ann C. Andersen (ABICE/UMR 7144/ Sorbonne Université), Erwan Ar Gall (LEMAR/UMR 6539/IUEM), Alexandrine Baffreau (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Touria Bajjouk (LEBCO/DYNECO/IFREMER), Hugues Blanchet (EPOC/UMR 5805/Université de Bordeaux), Pauline Cajeri (LIENSs/UMR 7266/Université de La Rochelle), Pauline Chauvet (LEP/EEP/IFREMER), Jean-Claude Dauvin (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Dominique Davoult (EFEB/UMR 7144/ Sorbonne Université), Thibaut de Bettignies (UMS 2006 PATRINAT), Marie-Noëlle de Casamajor (LRHAQ/IFREMER), Sandrine Derrien-Courtel (Station de Biologie Marine de Concarneau/MNHN), Stanislas Dubois (LEBCO/DYNECO/IFREMER), Marie-Claire Fabri (LERPAC/LITTORAL/IFREMER), Aurélie Foveau (FBN/LELRA/IFREMER), Franck Gentil (DIVCO/UMR 7144/ Sorbonne Université), Brigitte Guillaumont (LEP/EEP/IFREMER), Jacques Grall (UMS 3113/IUEM/UBO), Christian Hily (LEMAR/CNRS/IUEM/UBO), Céline Houbin (Station Biologique de Roscoff/OSU), Anne-Laure Janson (UMS 2006 PATRINAT), Marie La Rivière (UMS 2006 PATRINAT), Laurent Lévèque (Station Biologique de Roscoff/OSU), Line Le Gall (ISYEB/UMR 7205/MNHN), Sophie Lozach (M2C/UMR 6143/Université de Caen Normandie), Lénaick Menot (LEP/EEP/IFREMER), Josiane Popovsky (IMA), Céline Rolet (LOG/UMR 8187/Université Lille 1), Thierry Ruellet (GEMEL), Pierre-Guy Sauriau (LIENSs/UMR 7266/Université de La Rochelle), Nathalie Simon (AD2M/UMR 7144/Sorbonne Université), Laurent Soulier (IMA), Eric Thiébaut (DIVCO/UMR 7144/ Sorbonne Université), Julie Tourolle (LEP/EEP/IFREMER), Inge Van den Beld (LEP/EEP/IFREMER)
Auteurs de la table
PatriNat
Territoire(s) concerné(s)
Manche, Mer du Nord et Atlantique français
Organisme responsable
PatriNat
Langue d'origine des données
FR
Contexte
Compte tenu de l’intérêt grandissant des politiques publiques pour le milieu marin et de l’actualité chargée des différents programmes de gestion, de conservation ou d’inventaire (inventaires ZNIEFF, inventaire biologique et analyse écologique des habitats marins patrimoniaux des sites N2000 et des PNM, Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin, Système d’Information sur la Nature et le Paysage), le besoin de cohérence est élevé. Le développement de ces programmes nécessite la mise en place et l’utilisation d’outils tels que les référentiels. Ils permettent de définir un langage commun ainsi que les unités de travail. Parmi ces référentiels, il existe plusieurs classifications des habitats benthiques. Créées dans des contextes particuliers, elles répondent à des objectifs donnés, soit de connaissance et d’inventaire comme la typologie des ZNIEFF-Mer (Dauvin et al., 1994), soit de gestion et de conservation comme la typologie des habitats d’intérêt communautaire de l’Union Européenne (European Commission, 2007). Ces outils, adaptés à leur problématique, se rapportent à des échelles différentes : européenne pour Natura 2000 et EUNIS, nationale ou régionale pour les ZNIEFF. Il était nécessaire d’homogénéiser et d’harmoniser ces référentiels existants. Pour cela un nouveau référentiel national des habitats marins benthiques a été créé en synthétisant cet existant et en le complétant. Il est composé de deux typologies : une relative aux biocénoses de Méditerranée et l’autre concernant les habitats de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Son utilisation est préconisée pour l’ensemble des programmes ayant trait à la conservation des habitats marins à l’échelle nationale.
Description du travail
Cette typologie sert de référence à l’échelle nationale pour les habitats marins benthiques présents en Manche, en Mer du Nord et en Atlantique.
Sa première version, parue en 2013 (rapport explicatif Michez et al., 2013), était intégralement basée sur la proposition de typologie du REBENT (Guillaumont et al., 2008 et Bajjouk et al., 2011) à laquelle des habitats identifiés dans la bibliographie ou émanant de la communauté scientifique avaient été intégrés ainsi que certains habitats de la classification EUNIS (2008). Elle contenait 458 unités réparties en 7 niveaux. Suite à l’acquisition de nouvelles informations sur les habitats marins benthiques, une mise à jour de la typologie était nécessaire pour qu’elle soit le reflet des connaissances actuelles et a abouti à une deuxième version parue en 2015 (rapport explicatif Michez et al., 2015). Elle incluait 565 unités réparties en 6 niveaux. La version actuelle, la version 3, est parue en 2019 (rapport explicatif Michez et al., 2019). Elle comporte 664 unités hiérarchisées selon 5 niveaux. Par rapport à la version 2, le premier niveau hiérarchique a entièrement été modifié par soucis de cohérence avec la mise à jour d’EUNIS. Il se compose de 28 unités qui sont des combinaisons d’un étage et d’un type de substrat (par exemple les roches infralittorales). De nouveaux habitats ont été ajoutés, la codification a été totalement revisitée et la terminologie a été homogénéisée.
La collaboration de nombreux experts benthologues a été primordiale pour l'établissement et la consolidation de ce référentiel.
Origine du jeu de données
Fichier créé par Noëmie Michez et mis à jour par Marie La Rivière, Juliette Delavenne et Salomé Andres (PatriNat)
Références bibliographiques
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Référencement
PatriNat, 2023. Table de la typologie nationale des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l'Atlantique (NatHab-Atl). Base de données HabRef v7.
Dernière modification
Depuis la version 5.0 d'HABREF (novembre 2019), modifications de la version 3 de la typologie incluses dans la version 7.0 d'HABREF : 108 fiches descriptives complètes ont été ajoutées pour toutes les unités de niveau 2 et certains champs descriptifs ont été remplis pour 320 fiches de niveau 3 ou 4. Le libellé de 10 unités a été modifié (5 pour tenir compte de l'évolution de la taxonomie et 5 pour clarifier le cadre de l'unité). Une unité de niveau 3 a été supprimée et les 2 unités de niveau 4 qu'elle incluait ont été déplacées. Le statut de présence en France de 22 unités a été modifié en incertain (à confirmer).
Version 3 de la typologie incluse dans la version 5.0 d’HABREF, pour plus d’explications sur les modifications opérées dans cette version de la typologie se reporter au rapport : Michez N., Thiébaut E., Dubois S., Le Gall L., Dauvin J.C., Andersen A. C., Baffreau A., Bajjouk T., Blanchet H., de Bettignies T., de Casamajor M.-N., Derrien-Courtel S., Houbin C., Janson A.L., La Rivière M., Lévèque L., Menot L., Sauriau P.G., Simon N., Viard F., 2019. Typologie des habitats marins benthiques de la Manche, de la Mer du Nord et de l’Atlantique. Version 3. UMS PatriNat, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris, 52 p.
Source de l'ajout à la typologie
L’habitat A5-6 Herbiers à Zostera noltei sur sables médiolittoraux a été ajouté dans la version 3 de la typologie (Michez et al., 2019 ; source de l’ajout : N. Michez). Les herbiers de Zostera noltei étaient présents dès la première version de la typologie (Michez et al., 2013), sans distinction de substrat ou d’étage, dans la catégorie des habitats particuliers sous le code P01.01 Herbiers à Zostera noltei. Cet habitat a été modifié dans la version 3 de la typologie pour créer deux habitats de niveau 2, chacun représentatif d’un substrat différent (A5-6 Herbiers à Zostera noltei sur sables médiolittoraux et A6-4 Herbiers à Zostera noltei sur vases médiolittorales).
Facteurs abiotiques
Etage : Médiolittoral
Nature du substrat : Sables, Sables envasés
Répartition bathymétrique : >0m
Hydrodynamisme : Faible ; Modéré
Salinité : Milieu marin, Milieu à salinité variable
Température : Variable
Lumière : Système phytal
Régime trophique : Oligotrophe ; Mésotrophe
Caractéristiques stationnelles
L’habitat A5-6 est présent sur la partie supérieure du médiolittoral avec un taux d’émersion de 40 à 70% et sur des sédiments sableux parfois envasés (de 5 à 25% de particules fines). Cet habitat est présent aussi bien en conditions marines que dans des milieux à salinité variable tels que des estuaires ou des lagunes mais toujours dans des zones relativement abritées. Zostera noltei se reconnaît par ses feuilles longues jusqu’à ± 20 cm et très étroites (de 0,5 à 1,5mm ; Cabioc’h et al., 2014). Les herbiers à Zostera noltei constituent un habitat remarquable, à fort intérêt patrimonial et écologique et connu pour leur richesse.
Il semble utile de remarque qu’à l’heure actuelle, les connaissances concernant cet habitat semblent plus limitées que celles concernant les herbiers de Z. noltei sur vases (A6-4).
Variabilité
Cet habitat peut présenter une variabilité importante. Les principaux paramètres susceptibles de varier sont le recouvrement du substrat par Zostera noltei, influencé entre autres par la pression de broutage exercée par les oiseaux hivernant, et le degré d’envasement du substrat, directement lié à l’hydrodynamisme. L’habitat peut également être continu sur une grande surface ou bien être présent sous la forme de patchs entrecoupés par des zones de sédiments nus ou de roche en place. Les sous-habitats de niveau trois sont décrits sur leur page INPN respective.
Communautés ou espèces caractéristiques
L’espèce caractéristique de cet habitat est la zostère naine Zostera noltei (anciennement Zostera noltii).
Espèces associées
La liste fournie ne constitue pas une liste exhaustive des espèces associées à cet habitat. La bibliographie existante fait peu souvent la distinction entre substrat vaseux (A6-4) et sableux (A5-6) pour les herbiers de Zostera noltei, et les suivis DCE sur les herbiers de zostères naines ne portent pas à l’heure actuelle sur les peuplements associés. Ainsi, la liste d’espèces présentée ici se base sur les listes dressées dans la littérature scientifique concernant des habitats de zostères naines sur sédiments sableux (Asmus & Asmus 1985 ; Reise et al. 1994) et ne se veut pas exhaustive.
L’habitat A5-6 peut abriter des espèces d’annélides (ex : Arenicola marina, Capitella capitata, Heteromastus filiformis, Eteone longa, Phyllodoce mucosa, Pygospio elegans, Scoloplos (Scoloplos) armiger), des crustacés (ex : Bathyporeia sarsi, Carcinus maenas, Idotea balthica, Jaera (Jaera) albifrons), des bivalves (ex : Cerastoderma edule, Limecola balthica, Mya arenaria, Mytilus edulis) ainsi que des espèces de gastéropodes (ex : Littorina littorea, Littorina obtusata, Littorina saxatilis, Peringia ulvae, Retusa obtusa).
Dynamique temporelle
Cet habitat possède une dynamique temporelle importante. Le recouvrement et la superficie des herbiers varient selon les années, notamment à cause du broutage induit par les oiseaux hivernants mais également à cause de phénomènes naturels comme de violentes tempêtes. Ces herbiers présentent également une dynamique saisonnière avec la perte d’une partie des feuilles de zostères en hiver bien que ce phénomène soit minoritaire par rapport à l’impact des oiseaux.
Habitats pouvant être associés ou en contact
L’habitat A5-6 peut potentiellement être en contact avec tous les habitats sableux du supralittoral et de l’infralittoral (continuité bathymétrique) et du médiolittoral (contact de même niveau).
Habitats potentiellement en contact (liste non exhaustive) :
- A1-2 Roches et blocs médiolittoraux à dominance algale : contact de même niveau.
- A5-1 Sables supralittoraux : contact supérieur, continuité bathymétrique.
- A5-3 Sables fins médiolittoraux : contact de même niveau, mosaïques possibles.
- A5-4 Sables fins envasés médiolittoraux : contact de même niveau, mosaïques possibles.
- A5-5 Sables médiolittoraux en milieu à salinité variable : contact de même niveau, mosaïques possibles.
- B5-3 Sables fins envasés infralittoraux : contact inférieur, continuité bathymétrique.
-A6-4 Herbiers à Zostera noltei sur vases médiolittorales
Confusions possibles
L’habitat A5-6 peut potentiellement être confondu avec l’habitat A3-4 Herbiers à Zostera marina sur sédiments grossiers médiolittoraux mais une analyse granulométrique et une identification de l’espèce de zostère permettra la différenciation de ces deux habitats. L’habitat est également susceptible d’être confondu avec l’habitat A6-4 Herbiers à Zostera noltei sur vases médiolittorales, d’autant plus lorsque le sable est très envasé (proche de 25% de particules fines) et que la limite avec les vases sableuses (25-75% de particules fines) est floue. Une analyse granulométrique permettra néanmoins de différencier ces deux habitats qui peuvent être présents en continuité.
Répartition géographique
De manière générale, on observe une répartition discontinue de l’ouest Cotentin jusqu’au Pays Basque. Il semblerait que l’habitat ne soit pas présent au-delà du Cotentin en Manche et Mer du Nord mais cela reste à confirmer. Les lacunes peuvent persister quant à la répartition géographique de cet habitat car la distinction entre substrat sableux (A5-6) et vaseux (A6-4) est rarement faite dans la bibliographie.
Des herbiers sur substrat sableux ou sablo-vaseux ont été décrits dans l’estuaire de la Rance et dans l’estuaire du Trieux (Gerla, 2006), au niveau des marais de Mousterlin (TBM, 2000), en baie de Plouharnel (Robert & Chauvaud, 2004), dans l’estuaire de la Vilaine (TBM Environnement, 2008), au Croisic, à Marennes-Oléron (sablo-vaseux), dans les Pertuis-Breton (Sauriau et al., 2017), dans le lac d’Hossegor (bien qu’au vu de la forte variabilité sédimentaire interannuelle, une alternance entre l’habitat A5-6 et A6-4 semble exister ; Auby et al., 2020), dans l’estuaire de la Gironde au niveau du site DCE Bellevue-Perottine (Aubert et al., 2020) et dans le bassin d’Arcachon.
Fonctions écologiques
Les herbiers de zostères de manière générale et donc l’habitat A5-6 ont un rôle écologique et fonctionnel important. Ils possèdent d’importantes fonctions écologiques et offrent de nombreux services écosystémiques présentés ci-après (Tullrot, 2009 ; Hily, 2010 ; Angst et al., 2014 ; Sanchez et al., 2020).
Les herbiers de zostères atténuent l’hydrodynamisme ce qui favorise la sédimentation des particules sédimentaires et diminue la remise en suspension et l’érosion. Couplé à l’important réseau que forment les racines et les rhizomes des zostères, cela permet la stabilisation des sédiments. Les herbiers de zostères ont également un rôle dans la clarification de la colonne d’eau en abritant des organismes filtreurs en abondance. Les pieds de zostères tendent à retenir les débris de macroalgues à la dérive mais également les débris issus des zostères. Cela enrichit les sédiments en matière organique particulaire ce qui stimule l’activité bactérienne. Les herbiers de zostères ont également un rôle dans le cycle biogéochimique de nombreux éléments (azote, phosphore, oxygène, carbone).
Les zostères, et donc Zostera noltei, sont des espèces ingénieures qui structurent la biocénose benthique grâce à leur structure complexe et qui abritent de nombreuses espèces absentes des sédiments non végétalisés à proximité. Cet habitat a également un important rôle de zone de reproduction pour les juvéniles de poissons, de crustacés (ex : l’araignée de mer Maja brachydactyla) et de mollusques, et de réservoirs de nourriture pour certains poissons (bars, labridés) et oiseaux hivernants qui se nourrissent soit directement des zostères (ex : bernaches cravant, cygnes tuberculés, canards siffleurs, foulques macroules, cygnes noirs, oies cendrées), soit de la faune associée.
Statut de conservation
L’espèce Zostera noltei est inscrite sur la liste des espèces végétales protégées en région Pays de la Loire (Arrêté du 25 janvier 1993) et sur celle des espèces végétales protégées en région Basse-Normandie (Arrêté du 27 avril 1995). Elle est aussi considérée comme une espèce patrimoniale et déterminante ZNIEFF. Au titre de la DHFF (92/43/CEE), cet habitat est inclus dans l’Habitat d’Intérêt Communautaire (HIC) 1140 « Replats boueux ou sableux exondés à marée basse ». Il peut également correspondre à l’HIC 1130 « Estuaires » ou l’HIC 1150 « Lagunes côtières » sous réserve de respect des critères d'identification géomorphologiques et de délimitation physiographiques de l'HIC. Les herbiers de zostères naines au sens large sont également listés par la Convention OSPAR comme habitat menacé et/ou en déclin.
Tendance évolutive
Un phénomène de régression a été observé dans certaines zones, notamment celles impactées par les activités humaines (aménagements portuaires, corps morts) ou par des phénomènes naturels (eutrophisation, hausse de la turbidité). Cependant, les zones qui ne sont pas impactées par ces phénomènes peuvent présenter des herbiers en extension.
Si des changements de l’hydrodynamisme ambiant ont lieu, via des aménagements anthropiques, cela pourrait être responsable d’une modification du substrat avec par exemple, un potentiel envasement du milieu. On basculerait alors dans l’habitat A6-4 Herbiers à Zostera noltei sur vases médiolittorales.
Auteur(s)
Tauran A., Grall J.
Date de rédaction
2020
Bibliographie
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