Typologie nationale des biocénoses benthiques de Méditerranée (NatHab-Med)
Date de mise à jour du jeu de données
08/11/2021
Auteurs de la typologie
Noëmie MICHEZ (PatriNat), Annabelle AISH (PatriNat), Jean-Michel Amouroux, Gérard BELLAN (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Denise BELLAN-SANTINI (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Pierre CHEVALDONNE (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Guillaume DIRBERG (SPN, MNHN), Marie-Claire FABRI (IFREMER, LER), Thierry FERNEZ (Office de l’Environnement de la Corse), Maïa FOURT (GIS Posidonie), Patrice FRANCOUR (Université de Nice-Sophia Antipolis, EA 4228 ECOMERS), Guy-François FRISONI (Office de l’Environnement de la Corse), Adrien GOUJARD (GIS Posidonie), Jean-Georges HARMELIN (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294), Esther JORDANA (Centre d'Estudis Avançats de Blanes), Mario KLESCZEWSKI (Conservatoire d'Espaces Naturels, Languedoc-Roussillon), Céline LABRUNE (Observatoire Océanologique de Banyuls sur Mer, FRE 3350 LECOB), Jean-Baptiste MOURONVAL (Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage), Laura PALOMBA (SPN, MNHN), Thierry PEREZ (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Gérard PERGENT (Université de Corse Pasquale Paoli, UMR 6134 SPE), Christine PERGENT-MARTINI (Université de Corse Pasquale Paoli, UMR 6134 SPE), Stéphane SARTORETTO (IFREMER, LER), Thierry THIBAUT (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294), Jean VACELET (IMBE, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7263), Marc VERLAQUE (MIO, Université Aix-Marseille, CNRS UMR 7294)
Auteurs de la table
Marie LA RIVIERE, Noëmie MICHEZ (PatriNat, OFB-CNRS-MNHN)
Territoire(s) concerné(s)
Méditerranée française
Organisme responsable
PatriNat, OFB-CNRS-MNHN, anciennement SPN
Langue d'origine des données
FR
Contexte
Compte tenu de l’intérêt grandissant des politiques publiques pour le milieu marin et de l’actualité chargée des différents programmes de gestion, de conservation ou d’inventaire (inventaires ZNIEFF, inventaire biologique et analyse écologique des habitats marins patrimoniaux, Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin, Système d’Information sur la Nature et le Paysage), le besoin de cohérence est élevé. Le développement de ces programmes nécessite la mise en place et l’utilisation d’outils tels que les référentiels. Ils permettent de définir un langage commun ainsi que les unités de travail. Parmi ces référentiels, il existe plusieurs classifications des habitats benthiques. Créées dans des contextes particuliers, elles répondent à des objectifs donnés, soit de connaissance et d’inventaire comme la typologie des ZNIEFF-Mer (Dauvin et al., 1994), soit de gestion et de conservation comme la typologie des habitats d’intérêt communautaire de l’Union Européenne (European Commission, 2007). Ces outils, adaptés à leur problématique, se rapportent à des échelles différentes : européenne pour Natura 2000 et EUNIS, nationale ou régionale pour les ZNIEFF. Il a donc paru nécessaire d’homogénéiser et d’harmoniser les référentiels existants.
Description du travail
Ce travail a abouti à la création d’une liste de référence française des biocénoses, faciès et associations présents en Méditerranée. Elle a été élaborée en synthétisant et en actualisant les typologies existantes se rapportant aux habitats benthiques méditerranéens : la déclinaison française des habitats d’intérêt communautaire élaborée dans le cadre de Natura 2000 (Glémarec et Bellan-Santini in Bensettiti (coord.) et al., 2004), la classification des biocénoses benthiques marines de la région méditerranéenne élaborée dans le cadre de la Convention de Barcelone (PNUE, PAM, CAR/ASP, 2006 et 2007) ainsi que la liste des biocénoses de Méditerranée de l’inventaire ZNIEFF en PACA (Bellan-Santini et al., 2003). Ces classifications biocénotiques s’inscrivent dans la lignée des travaux de Pérès et Picard sur la définition des biocénoses benthiques de Méditerranée (Pérès et Picard, 1964). La typologie présentée dans ce travail ne comporte pas de changements majeurs. Les biocénoses décrites dans la littérature y ont été reportées et les principales modifications interviennent au niveau des faciès et des associations. Certains ont été supprimés, d’autres ont été ajoutés. Ils ont, pour la plupart, été conservés et peuvent avoir été regroupés, dissociés ou leur libellé a été modifié. Cette typologie est structurée en quatre niveaux. Le premier niveau correspond à l’étagement et le deuxième aux substrats et/ou le régime de salinité. Le troisième niveau fait apparaitre les biocénoses, le niveau quatre les faciès et associations de ces biocénoses. L’échelle de description de l’habitat (identifié par sa biocénose) correspond à l’échelle des habitats occupés par les macrophytes et la macrofaune benthiques. Les faciès et associations peuvent présenter un caractère saisonnier ou géographiquement localisé et ne constituent pas un niveau distinct mais un aspect particulier de la biocénose. Cette typologie de référence nationale peut être utilisée pour l’ensemble des programmes et outils qui concernent la façade méditerranéenne. Le niveau 3, celui de la biocénose, est généralement adapté aux problématiques de gestion et de conservation en permettant de nommer les habitats, notamment dans le cadre de travaux cartographiques. Le niveau des associations et des faciès est plus difficilement cartographiable à une certaine échelle (car nécessitant a priori des efforts d’échantillonnage élevés), mais reste néanmoins important pour la connaissance et leur prise en compte dans les études et inventaires. La première version de la typologie a été établie en 2011. Elle a été mise à jour en 2014 suite à de nouvelles acquisitions de connaissances. Un rapport détaillant les modifications effectuées entre ces deux versions (Michez et al., 2014) est disponible sur le site de l'INPN : http://spn.mnhn.fr/spn_rapports/archivage_rapports/2014/SPN%202014%20-%2033%20-%20Typologie_Mediterranee_version_2.pdf.
La description de chaque unité de niveaux 3 et 4 de cette typologie a été réalisée entre 2016 et 2021 (La Rivière et al., 2021). Au total le référentiel comporte 151 fiches descriptives pour les biocénoses, faciès et associations de la typologie (seul un faciès n'a pas été décrit). Les fiches descriptives se basent sur les descriptions d’habitats d’autres typologies lorsqu’elles sont disponibles et ont été complétées ou entièrement rédigées avec l’aide des experts benthologues.
Lors de cet exercice, 5 unités ont été supprimées de la typologie par manque de preuve de leur existence et 2 unités ont changé de statut de présence en France métropolitaine passant de "Présent" à "A confirmer".
Origine du jeu de données
Fichier créé par Noëmie MICHEZ (PatriNat) et mis à jour par Marie LA RIVIERE (PatriNat).
Références bibliographiques
La Rivière M., Michez N., Delavenne J., Andres S., Fréjefond C., Janson A-L., Abadie A., Amouroux J-M., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Cimiterra N., Derolez V., Fernez T., Fourt M., Frisoni G-F., Grillas P., Harmelin J-G., Jordana E., Klesczewski M., Labrune C., Mouronval J-B., Ouisse V., Palomba L., Pasqualini V., Pelaprat C., Pérez T., Pergent G., Pergent-Martini C., Sartoretto S., Thibaut T., Vacelet J., Verlaque M., 2021. Fiches descriptives des biocénoses benthiques de Méditerranée. UMS PatriNat éd., Paris : 660 pp.
Michez N., Fourt M., Aish A., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Fabri M.-C., Goujard A., Harmelin J.-G., Labrune C., Pergent G., Sartoretto S., Vacelet J., Verlaque M., 2014. Typologie des biocénoses benthiques de Méditerranée Version 2. Rapport SPN 2014 - 33, MNHN, Paris, 26 pp.
Référencement
PatriNat, 2021. Table de la typologie nationale des biocénoses benthiques de Méditerranée (NatHab-Med). UMS PatriNat / INPN, novembre 2021.
Dernière modification
Depuis la version 6.0 d'HABREF (décembre 2021) : modification du libellé de la typologie (NatHab-Med)
Depuis la version 5.0 d'HABREF (novembre 2019), 37 fiches descriptives ont été ajoutées et certaines fiches préalablement diffusées ont été complétées ou modifiées. Le libellé de 19 unités a été modifié (15 pour tenir compte de l'évolution de la taxonomie et 4 clarifier le cadre de l'unité). Une unité a été supprimée faute de preuves de son existence.
Depuis la version 4.0 d'HABREF (octobre 2017), 8 fiches descriptives ont été ajoutées concernant les biocénoses des substrats meubles supralittoraux, infralittoraux, circalittoraux et du bathyal.
Depuis la version 3.1 d'HABREF (janvier 2017), 13 fiches descriptives ont été ajoutées concernant les biocénoses des substrats meubles infralittoraux, le coralligène et leurs faciès.
Facteurs abiotiques
Etage : Infralittoral
Nature du substrat : Vase, Sable vaseux et Sable
Répartition bathymétrique : 0,5 à 1,5
Situation : Milieu sous faible influence des eaux marines
Hydrodynamisme : Faible à moyen
Salinité : 0 à 10
Température : Variable
Lumière : Forte luminosité mais tolère aussi des eaux turbides
Régime trophique : Fonds riches en matières organiques
Caractéristiques stationnelles
L’association se développe dans des eaux peu profondes (0,5 à 1,5 m), de salinité faible (0 à 10) sur des fonds riches en matières organiques. Les rhizomes de Stuckenia pectinata s'enfoncent profondément dans le sol, ce qui confère à la plante une grande résistance à l'hydrodynamisme, aux périodes de sécheresse et au gel. Les herbiers qu’elle forme se situent dans les secteurs les moins salés des lagunes et elle se rencontre également dans les rivières, les étangs, les lacs, les bassins et les fossés.
Variabilité
L’espèce Stuckenia pectinata est présente dans des lagunes peu profondes. Ses rhizomes s’enfoncent profondément dans le sol, ce qui confère à la plante une grande résistance à l’hydrodynamisme, aux périodes de sécheresse et au gel. La surface occupée par l’herbier varie selon l’ampleur de la zone dessalée.Lorsque la salinité varie, S. pectinata peut être remplacée par d’autres espèces. Les changements hydrologiques qui entrainent des variations importantes de salinité sur du long terme peuvent être une cause de disparition de Stuckenia pectinata.
Dynamique
Les herbiers peuvent perdurer plusieurs années. Ils se développent de manière importante jusqu’au début de l’automne puis diminuent en hiver.
Espèces caractéristiques
L’espèce caractéristique et structurante de cette association est Stuckenia pectinata (L.) Börner, 1912
Espèces associées
Les espèces associées comprennent le gastéropode brouteur Potamopyrgus antipodarum, des juvéniles de Mytilus edulis (installés sur les feuilles de Stuckenia et parmi les algues), des characées telles que Lamprothamnium papulosum (plus souvent rencontrée dans les habitats voisins), Chara baltica, Chara galioides, Chara tomentosa, des mysidacés et des épinoches Gasterosteus aculeatus nageant dans la végétation, ainsi que Mya arenaria. L’endofaune comprend probablement des oligochètes, Arenicola marina, Corophium volutator et Gammarus spp.
En mélange avec Ruppia spiralis (Syn. Ruppia cirrhosa) qui remplace S. pectinata aux salinités plus élevées.
Avec Myriophyllum spicatum, plus compétitive à très faible salinité.
Espèce patrimoniale rencontrée dans l'habitat : Anguille (Anguilla anguilla)
Principaux critères de reconnaissance
Vase infralittorale, en milieu à salinité faible, hébergeant des herbiers de Stuckenia pectinata. Les herbiers de S. pectinata forment souvent des tapis denses à la surface de l’eau.
Habitats associés ou en contact
III.1.1.b.Association à Ruppia maritima (Syn. Ruppia spiralis ; Syn. Ruppia cirrhosa)
Confusions possibles
Peu de confusions possibles. Stuckenia pectinata peut être confondue avec d’autres phanérogames occupant les mêmes milieux des genres Ruppia et Zannichellia.
Répartition géographique
Stuckenia pectinata est une espèce cosmopolite et commune en France. En Languedoc-Roussillon, elle est présente dans les étangs de l’Ayrolle, de Campignol, du Grand Bagnas et de l’Or. En Corse, elle est présente dans l’étang de Biguglia.
Structure et fonctions
Forme des herbiers denses pouvant servir de frayère et de nurserie.
La biomasse végétale est exploitée par les anatidés herbivores et granivores.
Intérêt pour la conservation
Les tiges, les feuilles, les graines de Stuckenia pectinata sont consommées par certains oiseaux d’eau (canards, foulques) durant leur hivernage. C'est une aire de frai et de développement d'alevins de poissons.
Stuckenia pectinata tend à devenir exclusive, à très forte biomasses dans des conditions eutrophes. Sa prolifération indique un milieu enrichi en nutriments souvent le fait d’activités anthropiques.
Menaces potentielles
La vulnérabilité et les menaces sur cette association sont celles de la biocénose de rattachement et notamment les remblaiements et activités d'urbanisation.
Auteur(s)
Michez N., Fréjefond C., Cimiterra N., Derolez V., Grillas P., Ouisse V. & Pasqualini V.
Date de rédaction
2021
Bibliographie
La Rivière M., Michez N., Delavenne J., Andres S., Fréjefond C., Janson A-L., Abadie A., Amouroux J-M., Bellan G., Bellan-Santini D., Chevaldonné P., Cimiterra N., Derolez V., Fernez T., Fourt M., Frisoni G-F., Grillas P., Harmelin J-G., Jordana E., Klesczewski M., Labrune C., Mouronval J-B., Ouisse V., Palomba L., Pasqualini V., Pelaprat C., Pérez T., Pergent G., Pergent-Martini C., Sartoretto S., Thibaut T., Vacelet J., Verlaque M., 2021. Fiches descriptives des biocénoses benthiques de Méditerranée. UMS PatriNat éd., Paris : 660 pp. (Source)
Michez, N., Fourt, M., Aish, A., Bellan, G., Bellan-Santini, D., Chevaldonné, P., Fabri, M.-C., Goujard, A., Harmelin, J.-G., Labrune, C., Pergent, G., Sartoretto, S., Vacelet, J. et Verlaque, M. 2014. Typologie des biocénoses benthiques de Méditerranée Version 2. Service du patrimoine naturel, Muséum national d'Histoire naturelle, Paris. SPN 2014 - 33: 26 pp. (Source)
Lauret M. Oheix J., Derolez V., Laugier T. 2011. Guide de reconnaissance et de suivi des macrophytes des lagunes du Languedoc-Roussillon. Réseau de Suivi Lagunaire (Ifremer, Cépralmar, Agence de l'Eau RM&C, Région Languedoc-Roussillon) : 148 pp
Pasqualini V., Derolez V., Garrido M., Orsoni V., Baldi Y., Etourneau S., Leoni V., Rébillout P., Laugier T., Souchu P., Malet N. 2017. Spatiotemporal dynamics of submerged macrophyte status and watershed exploitation in a Mediterranean coastal lagoon: understanding critical factors in ecosystem degradation and restoration. Ecological Engineering, 102, 1-14.
PNUE, PAM, CAR/ASP, 2007. Manuel d’interprétation des types d'habitats marins pour la sélection des sites à inclure dans les inventaires nationaux de sites naturels d’intérêt pour la Conservation. Pergent G., Bellan-Santini D., Bellan G., Bitar G. et Harmelin J.G. eds., CAR/ASP publ., Tunis, 199 pp.
van Dijk GM, Breukelaar AndréW, Gijlstra R. 1992. Impact of light climate history on seasonal dynamics of a field population of Potamogeton pectinatus L. during a three year period (1986–1988). Aquatic Botany. 43(1):17–41.
van Wijck C, de Groot C-J, Grillas P. 1992. The effect of anaerobic sediment on the growth of Potamogeton pectinatus L.: the role of organic matter, sulphide and ferrous iron. Aquatic Botany. 44(1):31–49.
Van Wijk RJ, Van Goor EMJ, Verkley JAC. 1988. Ecological studies on Potamogeton pectinatus L. II. Autecological characteristics, with emphasis on salt tolerance, intraspecific variation and isoenzyme patterns. Aquatic Botany. 32(3):239–260.
Van Wijk RJ. 1988. Ecological studies on Potamogeton pectinatus L. I. General characteristics, biomass production and life cycles under field conditions. Aquatic Botany. 31(3–4):211–258.
Verhoeven JTA, Van Vierssen W. 1978. Structure of macrophyte dominated communities in two brackish lagoons on the Island of Corsica, France. Aquatic Botany. 5:77–86.
English Version
