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La ZNIEFF est constituée par le lit de la rivière du Petit-Morin ainsi que les bords de ses berges. Ce cours d'eau, ainsi que sa vallée environnante sont renommés pour sa richesse en biodiversité. Les milieux aquatiques peuvent avoir un fort intérêt écologique là où ils sont végétalisés. Les berges sont favorables à diverses espèces faunistiques, lorsqu'elles sont en pente douce.
Le Petit Morin est une rivière connue pour abriter Zannichellia palustris, espèce protégée sur le plan régional. En outre, le cours francilien de la rivière a été proposé au titre de la Directive Habitats pour la présence de plusieurs espèces de poissons de l'annexe II. L'inventaire ZNIEFF a donc été homogénéisé avec les sites de la Directive.
Parmi les espèces d'oiseaux recensées, une est inscrite à l'Annexe 1 de la Directive Oiseaux: Dryocopus martius. A noter, la présence du Cincle plongeur (Cinclus cinclus) nicheur.
Cortège entomologique typique des rivières larges et boisées.
