L'intérêt écologique du site de Cercanceaux, installé dans la basse vallée du Loing, réside dans la diversité des milieux humides. Outre de nombreux plans d'eau issus d'anciennes exploitations de graves, le site constitue des reliques de boisements et de prairies humides, des marais traversés par des rus. Chaque milieu préserve un habitat pour une flore et une faune particulières offrant ainsi une biodiversité remarquable. Les prospections récentes n'ont pas permis de retrouver 4 espèces déterminantes vues en 1996 (Euphorbia esula L. subsp. esula, Hydrocharis morsus-ranae L., Potamogeton coloratus Hornem. et Selinum carvifolia (L.) L.) malgré leur présence probable.
Une faune entomologique intéressante est susceptible d'être présente sur ce site et mérite une prospection future exhaustive.