Ces coteaux abritent des pelouses calcaires du stade ras au stade ourlet, dépendantes de l'entretien appliqué (pâturage, fauche), mais aussi du substrat plus ou moins rocailleux. Localement des pelouses écorchées à Orpins sont même présentes.
Les pelouses rases sont les plus diversifiées pour la faune et la flore, avec en particulier le Lézard agile et l'Inule à feuilles de saule, deux espèces protégées, ainsi que d'autres espèces remarquables tels le Rhinanthe à feuilles étroites, le Lin à feuilles ténues ou l'Epipactis brun-rouge. Les pelouses sont globalement fort embroussaillées mais conservent une relativement bonne connexion pour former un réseau de milieux ouverts thermophiles sur près de 5 kilomètres.
La zone englobe par ailleurs une petite partie d'Aulnaie marécageuse près du ru du Rhône.
Ce site englobe une succession de savarts (pelouses calcicoles) longeant le coteau du vallon du Rhône et du Clignon, ainsi que des fruticées et boisements thermophiles. Les marais de fond de vallée n'ont pas été retenus du fait de leur dégradation par les plantations de peupliers.