La forêt d'Allogny est composée essentiellement de Chênaies-hêtraies où le Hêtre est plus ou moins présent selon les secteurs. Ces boisements sont pour la plupart acidiphiles, mais des zones neutrophiles à acidiclines apparaissent ça et là.
Hormis les Chênaies-hêtraie, on rencontre également des Chênaies-charmaies et surtout des Aulnaies-frênaies bordant les sources et les cours d'eau. Ce dernier type de boisement présente souvent un intérêt particulièrement fort.
La forêt d'Allogny abrite en outre un cortège faunistique intéressant : Sonneur à ventre jaune, Lucane cerf-volant, Triton marbré, etc.
Toutefois, les éléments d'intérêt écologique sont assez dilués sur l'ensemble de la zone et les habitats sont souvent dans un état de conservation moyen.
La zone, qui était une ZNIEFF de type I dans l'inventaire de première génération, a donc été passée en ZNIEFF de type II.
Le contour de la ZNIEFF englobe la Forêt Domaniale et les bois environnants participant de la même unité écologique.