Dominant la vallée de la Saire, le bois de Boutron repose en grande partie sur un substrat constitué de sables et graviers feldspathiques transformés par silicification en poudingues et arkoses barytinifères de très grande dureté. Ces conglomérats reposent sur le granite du Briovérien moyen.
FAUNE
Au niveau ornithologique, ce bois apparaît fort intéressant, car il renferme des espèces très rares telles la Bondrée apivore (Pernis apivorus), le Pic mar (Dendrocopos medius), l'Engoulevent d'Europe (Caprimulgus europaeus)...
Ensemble boisé renfermant des espèces animales rares.