Dans la partie nord du Haut-Morvan granitique, le site suit la vallée du Trinquelin. Le site comprend la partie nord du lac de Saint-Agnan et ses berges ainsi que le vallon boisé du Trinquelin. Massifs forestiers feuillus, pelouses, rochers et landes, ripisylves et quelques prairies humides de fond de vallon se partagent l’espace.
Ce site est d’intérêt régional pour ses habitats avec les espèces de faune et de flore qui y sont inféodées.
Une grande diversité d’habitats d’intérêt régional a été observée sur le site avec :
- des herbiers aquatiques des cours d’eau, d’intérêt européen,
- des mégaphorbiaies à Reine des prés (Filipendula ulmaria), d’intérêt européen,
- des ripisylves d’aulnes et de frênes, d’intérêt européen,
- des sources d’eau acides, d’intérêt régional,
- des prairies paratourbeuses, d’intérêt européen,
- des aulnaies marécageuses, d’intérêt régional,
- des végétations pionnières sur affleurement rocheux, d’intérêt européen,
- des pelouses à Nard raide (Nardus stricta) sur sols sains de l’alliance végétale du Violion caninae, d’intérêt européen,
- des landes sèches à Callune (Calluna vulgaris), d’intérêt européen,
- des frênaies-érablaies de ravin sur blocs, d’intérêt européen,
- des hêtraies à Houx (Ilex aquifolium) sur terrains acides, d’intérêt européen,
- des hêtraies sur terrains peu acides, d’intérêt européen.
Ces milieux variés accueillent un cortège diversifié d’espèces déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF avec notamment :
- la Stellaire des bois (Stellaria nemorum), plante des boisements humides, très rare en Bourgogne,
- la Fétuque des bois (Drymochloa sylvatica), plante forestière exceptionnelle en Bourgogne,
- l'Osmonde royale (Osmunda regalis), fougère des boisements humides, très rare en Bourgogne et protégée réglementairement,
- le Chabot (Cottus gobio), poisson d'intérêt européen.
- la Lamproie de Planer (Lampetra planeri), poisson d’intérêt européen indicateur d’une bonne qualité d’eau,
- le Polypode du hêtre (Phegopteris connectilis), fougère forestière montagnarde rarissime en Bourgogne,
- la Campanille à feuilles de lierre (Wahlenbergia hederacea), plante des bas-marais acides, protégée réglementairement, très rare en Bourgogne et en limite est de son aire de répartition,
- la Spargoute printanière (Spergula morisonii), plante annuelle naine des milieux sableux ou rocheux, rare en Bourgogne et protégée réglementairement,
- l'Engoulevent d'Europe (Caprimulgus europaeus), oiseau d’intérêt européen.
Ce patrimoine dépend :
- d’une gestion forestière à base de peuplements feuillus et de traitements adaptés aux conditions stationnelles (sol, climat, topographie, hydrographie), conservant les milieux annexes et notamment les ruisseaux,
- du maintien d’un élevage extensif dans les quelques trouées prairiales, prenant en compte les haies et les cours d’eau,
- d'une gestion douce des plans d'eau, respectueuse des herbiers aquatiques et des ceintures de végétation.
Il convient de maintenir le régime hydraulique des cours d'eau, sans seuils ni enrochement des berges et en respectant les ripisylves.
Périmètre délimité par :
- les secteurs de rochers de la Breuillot riches en pelouses, landes sèches,
- les têtes de bassin, de vallons et de secteurs importants pour la préservation de la fonctionnalité et de la qualité du milieux aquatique (poissons, ripisylves, herbiers aquatiques).
- secteurs tourbeux à forêts marécageuses,
- secteurs forestiers remarquables (hêtraie et forêts de ravin).