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Au cœur de la Champagne humide, sur les sables et argiles de l’Albien, la zone comprend :
- le vaste massif forestier de Pontigny, sur sols majoritairement argileux et sableux acides, riche en milieux associés (bois marécageux, landes sèches et humides),
- la vallée alluviale du Serein avec des prairies encadrant un cours d’eau très sinueux et bordé de ripisylves.
Ce site est d’intérêt régional pour ses habitats variés avec la faune et la flore inféodées.
La mosaïque d'habitats renferme des :
- végétations annuelles des limons fluviatiles, d’intérêt régional,
- landes humides atlantiques septentrionales, d’intérêt européen,
- landes sèches, d’intérêt européen,
- prairies à Molinie bleue sur sols humides et pauvres, d’intérêt européen,
- prairies de fauche, d’intérêt européen,
- frênaies-chênaies sub-atlantiques, d’intérêt régional,
- forêts de frênes et d'aulnes des cours d’eau, d’intérêt européen.
Dans ces habitats ont été répertoriées les espèces végétales déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF suivantes :
- Pyrole à feuilles rondes (Pyrola rotundifolia), plante des forêts sèches rarissime en Bourgogne,
- Osmonde royale (Osmunda regalis), fougère de bois humides très rare en Bourgogne, protégée réglementairement,
- Orchis incarnat (Dactylorhiza incarnata), orchidée des prairies et marais, très rare en Bourgogne et protégée réglementairement, en régression suite à la disparition des prairies humides,
- Ophioglosse vulgaire (Ophioglossum vulgatum), petit fougère rarissime en Bourgogne,
- Genêt d’Angleterre (Genista anglica), sous-arbrisseau de landes humides, rare en Bourgogne.
Le Serein accueille des poissons déterminants pour l’inventaire ZNIEFF avec :
- Chabot (Cottus gobio) et Lamproie de Planer (Lampetra planeri), deux poissons d’intérêt européen indicateurs d’une bonne qualité de l'eau,
- Vandoise (Leuciscus leuciscus), espèce frayant dans les fonds riches en graviers,
- Loche de rivière (Gobitis taenia), poisson d’intérêt européen,
- Brochet (Esox lucius).
Ce patrimoine dépend :
- d'un élevage extensif respectueux des milieux prairiaux, des haies, des cours d'eau et des mares,
- d’une gestion forestière à base de peuplements feuillus et de traitements adaptés aux conditions stationnelles (sol, climat, topographie, hydrographie), conservant les milieux annexes (landes, clairières, zones humides intraforestières, cours d'eau, ...).
Il convient de maintenir le régime hydraulique des cours d'eau, sans seuils ni enrochement des berges et en respectant les ripisylves.
Le périmètre est délimité par la forêt de Pontigny et la zone inondable de la vallée du Serein.
