Dans la partie nord du Haut-Morvan granitique où alternent massif boisés et bocage, le site comprend deux étangs et les milieux associés au fond de vallon situé entre-deux : boisements feuillus, parcelles enrésinées et quelques prairies bocagères à proximité de Saint-Andeux.
1/ Les eaux et les berges des étangs présentent des végétations amphibies vivaces des berges oligotrophes sur sables, ainsi que des herbiers aquatiques des eaux pauvres en éléments nutritifs; ces deux habitats sont d'intérêt européen. Diverses espèces déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF y ont été observées, notamment :
- la Littorelle (Littorella uniflora), protégée réglementairement,
- le Myriophylle à fleurs alternes (Myriophyllum alternifolium), également protégé réglementairement.
Certaines espèces ont été observées sur l’étang de Vernidard au début des années 90, mais n’ont pas été revues récemment malgré des prospections; ceci est probablement dû au fait de l’influence indirecte de la chasse sur l'étang du Vernidard. En effet, l'agrainage des canards engendre une forte pression de pâturage sur la végétation amphibie. Parmi les espèces historiquement présentes, il y avait entre autres :
- la Boulette d’eau (Pilularia globulifera), fougère protégée réglementairement,
- le Flûteau nageant (Luronium natans), plante aquatique d’intérêt européen.
2/ Des aulnaies marécageuses, habitats déterminants pour l'inventaire ZNIEFF, hébergent l'Osmonde royale (Osmunda regalis), espèce protégée réglementairement,
3/ Les prés tourbeux sont typiques du Haut-morvan et permettent l'expression d'habitats diversifiés relevant de l'alliance végétale du Juncion acutiflori, avec :
- des habitats très humides à Carum verticillé (Carum verticillatum) (association végétale du Caro verticillati-Juncetum acutiflori),
- des habitats moyennement humides (association végétale du Cirsio dissecti-Scorzoneretum humilis).
Y ont été répertoriés plusieurs espèces déterminantes dont :
- le Rossolis à feuilles rondes (Drosera rotundifolia), espèce protégée réglementairement,
- la Campanille à feuille de Lierre (Wahlenbergia hederacea), espèce protégée réglementairement, en limite est de son aire de répartition,
- la Parnassie des marais (Parnassia palustris),
- le Mouron délicat (Lysimachia tenella),
- le Lézard vivipare (Zootoca vivipara), reptile rare en Bourgogne.
4/ Le ruisseau du Vernidard, de première catégorie, abrite un cortège typique d’espèces déterminantes indicatrices de la bonne qualité des eaux telles :
- le Chabot (Cottus gobio), espèce d’intérêt européen,
- la Truite fario (Salmo trutta fario).
Ce patrimoine dépend de trois paramètres essentiels :
- gestion extensive des étangs (en particulier sans intrants et sans aménagements des berges) respectueuse des ceintures de végétation,
- maintien d’un élevage extensif (sans drainage), gage de la conservation des prés humides,
- gestion forestière à base de peuplements feuillus et de traitements adaptés aux conditions stationnelles (sol, climat, topographie, hydrographie), conservant les milieux annexes (cours d’eau intraforestiers, zones humides). La poursuite de l'enrésinement dans ce secteur serait dommageable.
Périmètre délimité par deux étangs et la portion de rivière les séparant. Les milieux riverains ont été englobés.