Au cœur de la Haute-Puisaye, sur les dépôts de sables et d’argiles de l’Albien, la zone correspond à un petit talweg englobant des massifs boisés, des clairières prairiales et deux étangs (étang de Charmoy et étang des Religieuses).
Ce site est d’intérêt régional pour ses habitats humides riches en espèces végétales rares, avec notamment le cortège remarquable de plantes des berges de plan d’eau.
L'étang de Charmoy, moyennement pauvre en éléments nutritifs, présente en particulier des formations d'exondation à annuelles ou vivaces, et localement, à la faveur d'arrivées d'eau, des berges paratourbeuses. Ces habitats sont donc étroitement conditionnés par un marnage estival des eaux :
- végétation enracinée flottante, d’intérêt régional,
- végétation enracinée immergée, d’intérêt régional,
- végétation amphibie vivace des berges sableuses exondées, d’intérêt européen,
- végétation amphibie vivace des berges tourbeuses exondées, d’intérêt européen,
- végétation amphibie annuelle à Eleocharis acicularis (de l'alliance végétale de l'Eleocharition acicularis), d’intérêt européen,
- végétation annuelle sur vases exondées à Bidens (Bidens tripartitus), d’intérêt régional,
- petites roselières amphibies,
- saulaie marécageuse.
Au niveau de cet étang ont été répertoriées les espèces végétales déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF suivantes :
- Jonc nain (Juncus pygmaeus), plante pionnière des substrats humides acides, exceptionnelle en Bourgogne,
- Cicendie filiforme (Cicendia filiformis), plante naine herbacée annuelle, exceptionnelle en Bourgogne,
- Lobélie brûlante (Lobelia urens), plante de prairie humide exceptionnelle en Bourgogne, en limite est de son aire de répartition,
- Flûteau fausse-renoncule (Baldellia ranunculoides), plante amphibie exceptionnelle en Bourgogne et protégée réglementairement,
- Boulette d'eau (Pilularia globulifera), fougère amphibie rarissime en Bourgogne, inscrite au livre rouge de la flore menacée de France et protégée réglementairement,
- Elatine à six étamines (Elatine hexandra), plante amphibie rarissime en Bourgogne et protégée réglementairement.
En périphérie de l’étang et au niveau des boisements proches, d’autres types d’habitats sont présents avec :
- prairie de fauche mésophile, d’intérêt européen,
- prairie à Juncus acutiflorus (dérivant de l'alliance du Juncion acutiflori), d’intérêt régional,
- bordure humide des cours d’eau à hautes herbes, d’intérêt européen,
- chênaie ligérienne acidiphiles à Peucédan de France (Peucedanum gallicum), d’intérêt européen,
- chênaie pédonculée sur sol humide pauvre et acide à Molinie, d’intérêt européen,
- aulnaie-frênaie de bord de cours d’eau, d’intérêt européen,
- aulnaie marécageuse, d’intérêt régional,
- prairie pâturée sur sol sain.
Ce patrimoine dépend :
- d’une gestion forestière à base de peuplements feuillus et de traitements adaptés aux conditions stationnelles (sol, climat, topographie, hydrographie), conservant les milieux humides intraforestiers,
- d'un élevage extensif respectueux des milieux prairiaux et des haies,
- d'une gestion douce des plans d'eau, respectueuse des herbiers aquatiques et des ceintures de végétation, privilégiant notamment des berges sans enrochements, une limitation des engrais et une variation des niveaux d’eau.
Le périmètre est délimité par les secteurs riches en habitats et plantes rares. Il englobe ainsi étangs, prairies et bois.