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La cuesta qui sépare le Pays d’Arnay-le-duc au nord, de la plaine autunoise au sud, deux régions à dominante bocagère, recoupe plusieurs niveaux géologiques : les grès (parfois à ciments calcaires) et les argiles du Trias, puis en partie basse les terrains sédimentaires primaires du Bassin houiller. Localement, au contact des grès et des argiles, des sources alimentent quelques milieux humides. Les habitats sont donc très variés, avec des gradients écologiques allant de l'humide au sec et des terrains acides à riches en calcaires.
Le site est d'intérêt régional pour sa richesse en habitats patrimoniaux, avec la flore associée.
Plusieurs milieux humides, de faibles surfaces mais déterminants pour l’inventaire ZNIEFF, ont été notés :
- prés à Jonc acutiflore (Juncus acutiflorus),
- mares avec herbiers aquatiques à Potamots,
- mares avec herbiers aquatiques à Characées.
Sur le mont Bouton s'étend une pelouse sèche calcicole de l’alliance végétale du Mesobromion, habitat d’intérêt européen. Cette pelouse abrite des espèces des milieux secs rares dans l'autunois, comme l’Hélianthème des Apennins (Helianthemum apenninum), la Fumane couchée (Fumana procumbens) ou la Laîche de Haller (Carex halleriana). L'habitat est également présent ailleurs sur le site, mais sous des formes souvent appauvries en espèces des milieux secs.
D’autres habitats secs déterminants ont été répertoriés sur ce site :
- prairies maigres de fauche,
- falaises gréseuses,
- ourlets sur terrains secs et riches en calcaires (grès à ciments calcaires).
Ces milieux hébergent deux espèces végétales protégées réglementairement :
- la Spiranthe d’automne (Spiranthes spiralis),
- l’Orobanche blanche (Orobanche alba).
Sur le bord de la cuesta, les habitats forestiers correspondent essentiellement à de la chênaie-charmaie avec :
- une variante sèche sur terrains riches en calcaire, sur le rebord du coteau gréseux,
- une variante sur terrains faiblement acides.
Dans les ornières forestières et les prairies humides ont été observées des espèces déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF :
- le Sonneur à ventre jaune (Bombina variegata), crapaud d’intérêt européen,
- la Laiche à épis distants (Carex distans), plante rarissime en Bourgogne.
Ce patrimoine est étroitement dépendant de la perpétuation des pratiques d’élevage extensif traditionnel, gage du maintien des haies et des milieux prairiaux.
Le périmètre comprend un tronçon du rebord de la cuesta gréseuse, allant du rebord du plateau jusqu'au bas de pente.
