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Sur les alluvions quaternaires du val de Saône, le site englobe une petite portion de l’agglomération chalonnaise, dont le lac des Prés Saint-Jean, un tronçon du cours de la Saône, et un secteur de plaine comprenant des plans d’eau artificiels, des zones cultivées ainsi que des petits secteurs de prairies et de boisements alluviaux relictuels.
Ce site est d’intérêt régional pour ses espèces de faune et de flore inféodées aux zones alluviales.
Un bâtiment en centre ville de Chalon accueille une colonie de mise-bas de Grand Murin (Myotis myotis) en bâtiment (une centaine d'adultes); la protection de cette chauve-souris est reconnue d'intérêt européen. Les territoires de chasse de l'espèce comprennent des prairies inondables, des haies, des bordures de cours d’eau, des plans d’eau ainsi que des boisements alluviaux.
Le secteur englobe le secteur de Moirot à Chatenoy-en-Bresse qui comprend un ensemble relictuel de prairies de fauche inondables (alliance végétale du Bromion racemosi), habitat d’intérêt européen riche en espèces déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF avec notamment :
- la Fritillaire pintade (Fritillaria meleagris), espèce menacée par la conversion des prairies en culture,
- l'Orchis incarnat (Dactylorhiza incarnata), orchidée protégée réglementairement, en régression suite à la disparition des prairies humides,
- l'Ophioglosse vulgaire (Ophioglossum vulgatum), petit fougère rare en Bourgogne.
Le cours de la Saône présente également des habitats d’intérêt régional (ici de surface réduite) avec :
- des herbiers aquatiques à grands potamots du lit de la Saône,
- des ourlets humides d’intérêt européen,
- des boisements alluviaux relictuels, d’intérêt européen,
- de la végétation des dépôts de limon.
Des roselières, des cariçaies ainsi que des boisements rivulaires de saules sont également présents sur les bords du cours d’eau.
Sur les berges de la Saône plusieurs espèces déterminantes pour l’inventaire ZNIEFF ont été observées, tels :
- l'Inule des fleuves (Inula britannica), plante inscrite au livre rouge de la flore menacée de France,
- le Pigamon jaune (Thalictrum flavum).
Enfin, le lac des Prés Saint-Jean constitue une zone importante pour la halte migratoire des oiseaux parmi lesquels :
- le Canard pilet (Anas acuta),
- le Canard chipeau (Anas strepera),
- le Grèbe jougris (Podiceps grisegena),
- Sarcelle d'été (Anas querquedula).
Le Crapaud calamite (Bufo calamita) est présent dans ce secteur en période de reproduction. C'est un amphibien dont la répartition est très morcelée en Bourgogne. Il est menacé par la disparition des zones humides.
Ce patrimoine dépend :
- du maintien de pratiques de fauche dans les prairies,
- du maintien des linéaires boisés,
- de l’absence de dérangement dans les bâtiments qui accueillent les chauves-souris.
Le périmètre est délimité :
- par les terrains de chasse des jeunes chauves-souris autour des gîtes de mise-bas,
- par les habitats d'intérêt régional (prairies, berges et lits de la Saône, îles boisées).
- par les stations d'espèces végétales déterminantes.
Il englobe le bloc de bâtiment où les chauves-souris sont présentes, ainsi que les jardins urbains qui mènent à la Saône.
