Les chaumes du Markstein abritent une flore remarquable spécifique des hautes chaumes : Pulsatille blanche, plusieurs espèces d'orchidées et notamment des hybrides assez rares , lycopodes (petites fougères) etc. En matière de plante remarquable, soulignons que le Markstein est surtout connu comme étant un site majeur pour la cueillette d'Arnica : les populations de cette plante médicinale sont les plus fortes du massif vosgien, voire de France. L'espèce bénéficie d'ailleurs d'une convention pour préserver la ressource.
Ensemble des chaumes en bon état de conservation du Markstein, avec présence d'espèces patrimoniales (Pulsatille blanche, Arnica etc.)