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Description
Sous nos latitudes, la cohabitation entre les chauves-souris et l'homme s'est amorcée depuis quelques centaines de milliers d'années. Durant les périodes glaciaires, cependant, les chauves-souris ont été contraintes de migrer au sud à la recherche de conditions plus clémentes. Ce n'est qu'avec le réchauffement climatique intervenu 6000 ans avant notre ère que leur peuplement est devenu assez semblable à ce qu'il est actuellement. Toutefois, la forêt était alors prédominante et les espèces forestières majoritaires. La sédentarisation de l'homme et le développement de l'élevage se sont progressivement traduits par une expansion des paysages semi-ouverts dont ont profité d'autres espèces. En parallèle, le développement des constructions et l'urbanisation ont favorisé les chauves-souris thermophiles qui utilisent les bâtiments comme gîte de mise-bas en été.
Du fait de leur cycle de vie, les chauves-souris nécessitent plusieurs types d'habitats au cours de l'année : des gîtes pour l'hibernation, d'autres pour la mise-bas estivale, mais aussi des sites intermédiaires et des terrains de chasse, reliés par des axes de transit. Les changements de gîtes sont généralement constants d'une saison à l'autre et la plupart des espèces montrent une grande fidélité aux gîtes d'hiver et de mise-bas.
A Arbois, l'église de Saint-Just, classée monument historique, abrite une colonie de Grand murin en période estivale. Ce site revêt un intérêt départemental. Les effectifs oscillent entre 120 et 200 femelles qui viennent pour mettre bas et élever leur unique jeune. Cette espèce nécessite de vastes bâtiments pour sa reproduction. Ici, la colonie a élu domicile dans le clocher.
Les terrains de chasse changent régulièrement au cours de l'année en fonction des concentrations en insectes. Au final, les biotopes de transition assurent les meilleures sources de nourriture, particulièrement ceux situés non loin de l'eau : haies riveraines, cours d'eau, zones humides, mais aussi lisières forestières et forêts. Pour le Grand murin, la majorité des terrains de chasse se situe dans un rayon de 10 à 15 kilomètres autour de la colonie. Le glanage d'insectes posés au sol (coléoptères de grande taille, orthoptères) est un comportement caractéristique de cette espèce. De ce fait, elle privilégie des structures paysagères où le sol reste très accessible : futaies feuillues au couvert arbustif ou herbacé rare, vergers pâturés ou prairies naturelles non fertilisées. En ce sens, la grande variété des paysages du Vignoble se révèle très favorable.
Statut de protection
L'arrêté ministériel du 23/04/07 assure une protection stricte des chauves-souris et interdit la destruction ou l'altération des sites de reproduction ou des aires de repos, dont fait partie ce bâtiment.
Objectifs de préservation
Il est impératif d'assurer la tranquillité des colonies en période estivale, durant laquelle les individus sont vulnérables (juin à août). La fermeture des accès des gîtes, les travaux sur les toitures, le traitement des charpentes ou l'éclairage de l'édifice constituent autant d'autres menaces pour la pérennité des colonies. A cet effet, une convention pour une gestion concertée du site est en cours d'élaboration avec la commune.
En outre, la préservation de territoires de chasse riches en insectes est essentielle. La disparition des prairies, l'arasement des haies et ripisylves, l'assèchement des zones humides, l'utilisation de pesticides et d'avermectines sont autant de causes supplémentaires de disparition des colonies de reproduction. En particulier, les traitements vermifuges des bovins à base d'avermectines doivent être strictement encadrés : dans les déjections, l'action létale de ces molécules sur les insectes coprophages se prolonge durant plusieurs semaines.
