La ZNIEFF de l'Aber Ildut comprend l'Aber Ildut et sa petite anse latérale de Milin an Aod, et s'arrête sur l'amont à Pont Reun où cesse l'influence des marées.
Les habitats terrestres déterminants se localisent à l'entrée de l'estuaire et sont la végétation des fissures de rochers et éléments de pelouses aérohalines qui se trouvent en falaise, ainsi qu'un placage sableux situé sur la Pointe de Beg ar Groaz et au dessus de la petite plage attenante, et portant des éléments de dune grise.
C'est à ce niveau que se trouvent 2 plantes menacées de la Liste rouge armoricaine et déterminantes pour les ZNIEFF : la scille printanière (Scilla verna) et la cochléaire officinale (Cochlearia officinalis). La criste marine (Crithmum maritimum) présente à plusieurs niveaux sur le trait côtier est concernée par l'arrêté préfectoral du 27 juin 1991 réglementant sa cueillette.
Les habitats déterminants de l'estuaire sont les communautés de pré-salé à obione ou à chiendent littoral présentes de manière fragmentaire des deux cotés de l'estuaire mais pratiquement jusqu'à l'amont de la zone, ainsi que la vasière et les rochers médiolittoraux qui sont à marée basse des lieux de nourrissage et de repos importants pour l'avifaune côtière hivernante de l'aber.
29 espèces d'oiseaux presque tous hivernants ou de passage ont été recensées entre les données de la ZNIEFF initiale et les plus récents recensements sur cette côte (ces derniers associent les 2 abers Ildut et Benoît et la côte qui les sépare - source n° 52). Sans doute aucun oiseau hivernant dans l'Aber Ildut n'atteint des effectifs suffisants pour être retenu comme déterminant pour cette seule ZNIEFF. Toutefois il est probable que le Tournepierre à collier, le Bécassseau variable et le Chevalier gambette soient présents en effectifs notables.
Selon les ornithologues locaux, la création d'un sentier de randonnée réalisant tout le tour de l'aber a augmenté les dérangements faits à l'avifaune hivernante qui ne dispose plus de zones de tranquillité et de refuge.
Autres espèces présentes sur le site:
ACER PSEUDOPLATANUS
AGROSTIS STOLONIFERA subsp. STOLONIFERA
AIRA CARYOPHYLLEA
ANGELICA SYLVESTRIS
ANTHOXANTHUM ODORATUM
ANTHRISCUS CAUCALIS
APIUM NODIFLORUM
ARMERIA MARITIMA
ASTER TRIPOLIUM
ATRIPLEX HASTATA
BETA VULGARIS subsp. MARITIMA
BORRAGO OFFICINALIS
BROMUS HORDEACEUS subsp. THOMINII
CALYSTEGIA SEPIUM subsp. SEPIUM
CALYSTEGIA SOLDANELLA
CARDAMINE PRATENSIS
CAREX ARENARIA
CENTAUREA DEBEAUXII
CERASTIUM DIFFUSUM
CERASTIUM GLOMERATUM
COCHLEARIA ANGLICA
COCHLEARIA DANICA
CONOPODIUM MAJUS
CONYZA FLORIBUNDA
CORYDALIS CLAVICULATA subsp. CLAVICULATA
CRASSULA TILLAEA
CREPIS CAPILLARIS
CYNODON DACTYLON
DACTYLIS GLOMERATA
DAUCUS CAROTA subsp. GUMMIFER
DESMAZERIA MARINA
DIGITALIS PURPUREA
ELEOCHARIS UNIGLUMIS
ELYMUS FARCTUS
ELYMUS PYCNANTHUS
ELYMUS REPENS
ERODIUM MOSCHATUM
ERYNGIUM CAMPESTRE
EUPHORBIA PORTLANDICA
FAGUS SYLVATICA
FRANKENIA LAEVIS
FUMARIA CAPREOLATA
GALIUM APARINE
GALIUM ARENARIUM
GALIUM PALUSTRE
GERANIUM MOLLE
GLAUX MARITIMA
GLYCERIA FLUITANS
HALIMIONE PORTULACOIDES
HEDERA HELIX
HERACLEUM SPHONDYLIUM subsp. SPHONDYLIUM
HOLCUS LANATUS
HONKENIA PEPLOIDES
HYACINTHOIDES NON-SCRIPTA
HYDROCOTYLE VULGARIS
IRIS PSEUDACORUS
JUNCUS ACUTIFLORUS
JUNCUS GERARDI subsp. GERARDI
LAGURUS OVATUS
LOTUS CORNICULATUS
LOTUS SUBBIFLORUS subsp. SUBBIFLORUS
LUZULA CAMPESTRIS
LYCHNIS FLOS-CUCULI subsp. FLOS-CUCULI
LYTHRUM SALICARIA
MALVA MOSCHATA
MONTIA FONTANA
MYOSOTIS RAMOSISSIMA
NASTURTIUM OFFICINALE
OENANTHE CROCATA
ORNITHOPUS PERPUSILLUS
PARIETARIA DIFFUSA
PHRAGMITES AUSTRALIS
PLANTAGO CORONOPUS
PLANTAGO LANCEOLATA
PLANTAGO MARITIMA
POLYGONUM AMPHIBIUM
POLYPODIUM INTERJECTUM
POTENTILLA ANSERINA
POTENTILLA REPTANS
PRUNELLA VULGARIS
PRUNUS SPINOSA
QUERCUS ROBUR subsp. ROBUR
RANUNCULUS FICARIA subsp. FICARIA
RANUNCULUS FLAMMULA
RANUNCULUS REPENS
ROSA PIMPINELLIFOLIA
RUMEX ACETOSA subsp. ACETOSA
RUMEX CONGLOMERATUS
RUMEX CRISPUS
RUMEX OBTUSIFOLIUS
RUSCUS ACULEATUS
SAGINA MARITIMA
SCIRPUS LACUSTRIS subsp. TABERNAEMONTANI
SCIRPUS MARITIMUS subsp. MARITIMUS
SEDUM ANGLICUM
SEDUM ACRE
SENECIO VULGARIS
SILENE DIOICA
SILENE VULGARIS subsp. MARITIMA
SONCHUS ASPER
SONCHUS OLERACEUS
SPERGULARIA MEDIA
SPERGULARIA RUPICOLA
STELLARIA ALSINE
STELLARIA HOLOSTEA
STELLARIA MEDIA
TEESDALIA NUDICAULIS
TEUCRIUM SCORODONIA subsp. SCORODONIA
TRIFOLIUM ARVENSE
TRIFOLIUM CAMPESTRE
TRIFOLIUM DUBIUM
TRIFOLIUM OCCIDENTALE
TRIFOLIUM PRATENSE
TRIFOLIUM REPENS
TRIGLOCHIN MARITIMA
ULEX EUROPAEUS
ULMUS MINOR
UMBILICUS RUPESTRIS
URTICA DIOICA
VALERIANELLA LOCUSTA
VICIA SATIVA SATIVA
VIOLA RIVINIANA
ASPLENIUM ADIANTUM-NIGRUM
ASPLENIUM BILLOTII
PTERIDIUM AQUILINUM
EQUISETUM FLUVIATILE
ALCEDO ATTHIS
ANAS PENELOPE
ANAS PLATYRHYNCHOS
ARDEA CINEREA
ARENARIA INTERPRES
CALIDRIS ALBA
CALIDRIS ALPINA
CALIDRIS CANUTUS
CALIDRIS MARITIMA
CHARADRIUS HIATICULA
CORVUS MONEDULA
EMBERIZA SCHOENICLUS
FULICA ATRA
GALLINULA CHLOROPUS
HAEMATOPUS OSTRALEGUS
LARUS ARGENTATUS
LARUS CANUS
LARUS MELANOCEPHALUS
LIMOSA LAPPONICA
MERGUS ALBELLUS
MERGUS MERGANSER
MOTACILLA CINEREA
NUMENIUS ARQUATA
PLUVIALIS SQUATAROLA
PHALACROCORAX CARBO
TACHYBAPTUS RUFICOLLIS
TRINGA HYPOLEUCOS
TRINGA NEBULARIA
TRINGA TOTANUS
Le périmètre reste très proche du précédent. Le secteur côtier de la Pointe de Beg ar Groaz près de Porscav, qui concentre quelques habitats et plantes remarquables, est mieux pris en compte.La frange côtière terrestre incluse dans la zone reste très limitée et ne concerne pas de maisons d'habitation.