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Ces anciennes carrières présentent un intêrêt majeur pour la conservation de nombreuses espèces de chiroptères. Ce site assure l'hivernage et le transit pour une population importante de chiroptères dont le Minioptère de Screibers, le Grand et Petit Rhinolophe et le Vespertilion à oreilles échancrées. Pour cette dernière espèce, il s'agit du seul site connu en Lot-Garonne à ce jour.
Des suivis complémentaires seraient nécessaires pour déterminer d'éventuels cas de reproduction et évaluer sur plusieurs années les effectifs moyens dans les grottes.
La limite de la ZNIEFF comprend les gîtes et une zone de protection autour des gîtes.
