Tout comme le réseau hydrographique amont du gave d'Ossau, le réseau hydrographique du gave d'Aspe constitue un secteur bien particulier du réseau hydrographique du gave d'Oloron, d'intérêt patrimonial majeur. On y observe notamment une population relativement abondante d'écrevisses à pattes blanches, espèces en très forte régression en Aquitaine, ainsi qu'une population assez abondant de chabots, vraisemblablement constituée de chabots de l'Adour, espèce endémique du bassin versant de l'Adour.
L'intérêt faunistique de cette ZNIEFF est complété par la présence du desman des Pyrénées et de la loutre.
Les principales menaces résultent des impacts d'un éventuel surpâturage sur les berges des cours d'eau ainsi que de l'aménagement de micro-centrales.