La ZNIEFF du ruisseau de Pont de Mol se situe sur la commune du Bouyssou, dans la zone cristalline du Ségala lotois, sur la frange occidentale du Massif central, entre la zone cristalline et la zone marneuse. La superficie est d’environ 18 ha pour une altitude moyenne de 319 m. Le bassin versant est essentiellement occupé par des bois et des prairies d’élevage. Le milieu concerné est un ruisseau de première catégorie piscicole, avec des eaux fraîches, une granulométrie grossière et un peuplement typique et conforme au niveau typologique du ruisseau. Le bassin versant du ruisseau de Pont de Mol abrite de la Truite fario, de la Loche franche et du Chabot, espèces protégées au titre de l’arrêté ministériel du 08/12/1988. Toutes ces espèces présentes sur ce bassin versant ont des exigences écologiques communes en matière de qualité d’eau et d’habitats, et trouvent sur ce secteur des zones propices pour leur reproduction et leur alimentation.
Les critères de délimitation ont été définis en fonction des connaissances et des prospections réalisées sur le bassin versant du ruisseau de Pont de Mol. Sur tout ce linéaire, la présence de l’espèce a été constatée, et les caractéristiques hydromorphodynamiques de ces ruisseaux correspondent à l’habitat préférentiel de l’espèce repère.