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Le Bugey, situé sur la partie est du département de l'Ain, constitue la partie méridionale du massif du Jura. Les précipitations sont particulièrement abondantes dans cette région puisqu'on relève souvent plus de 1500 mm sur l'année. Le substrat calcaire date du secondaire et a été soulevé au tertiaire, préfigurant les reliefs actuels. Le marais de bois de Cros appartient aux tourbières dites alcalines. Elles se développent sur des sols riches en calcaire. La tourbe qui s'y accumule est formée de nombreuses laîches mais aussi de mousses particulières : les hypnacées. Les tourbières alcalines sont fortement présentes dans les vallées alluviales et les Préalpes calcaires où l'influence des glaciers jurassiens et alpiens a été importanteElles représentent 55% de la surface des tourbières de la région. Les milieux de tourbières alcalines sont très variés. Différents habitats naturels se juxtaposent sur ce site : "bas-marais" (marais tout ou partie alimentés par la nappe phréatique), groupement végétal à Reine des prés , cariçaie (formation végétale dominée par les laîches), prairie humide… Dans certains secteurs, des plantations d'épicéas se superposent à ces habitats. La diversité floristique de ces milieux humides est relativement importante. Citons, par exemple, le Fenouil des chevaux, relativement répandu dans l'Ain, ou encore la Scorsonère humble, protégée.
