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Le massif du Bas-Bugey est une région d’une très grande richesse biologique. A l'écart des principales voies de communication, il reste bien préservé. Mais c'est sa physionomie qui présente le plus d'intérêt. De la plaine du Rhône au sommet du massif (Molard Dedon, 1219 m), le dénivelé est de près de 1000 m. Les conditions climatiques rencontrées sur l'ensemble du massif sont particulièrement variées et permettent une grande diversité botanique. Les milieux rencontrés sont aussi divers que tourbières, lacs, forêts montagnardes, pelouses sèches, pâturages, falaises... Le massif boisé d’Aillon présente des escarpements rocheux propices à l’installation d’une certaine avifaune, et, sur ses marges, des pelouses sèches, résultant d’une exploitation traditionnelle des sols. Ces pelouses sèches de type Mesobromion (pelouse maigre dominée par une graminée : le Brome dressé) correspondent à un des stades les moins évolués de la chênaie pubescente. Le Mesobromion, habitat naturel menacé qui comptent parmi ceux dont la protection est considérée comme un enjeu européen, est un milieu d'une très grande richesse biologique. D'une manière générale, la flore de la plupart de ces prairies est très diversifiée, et l'on y retrouve l'ensemble du cortège caractéristique de ce milieu. Ces milieux ouverts constituent le terrain de chasse du Circaète Jean-le-Blanc. La présence de ce rapace témoigne d'un milieu préservé, où les activités agricoles et forestières sont peu intensives et le dérangement humain pas trop important. Le Faucon pèlerin est également présent. Une part importante des effectifs français de cette espèce niche dans le département de l'Ain.
