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Le massif du Bas-Bugey est une région d’une très grande richesse biologique. A l'écart des principales voies de communication, il reste bien préservé. Mais c'est sa physionomie qui présente le plus d'intérêt. De la plaine du Rhône au sommet du massif (Molard Dedon, 1219 m), le dénivelé est de près de 1000 m. Les conditions climatiques rencontrées sur l'ensemble du massif sont particulièrement variées et permettent une grande diversité botanique. Les milieux rencontrés sont aussi divers que tourbières, lacs, forêts montagnardes, pelouses sèches, pâturages, falaises... Le lac de Maubois appartient aux tourbières dites alcalines. Elles se développent sur des sols riches en calcaire. La tourbe qui s'y accumule est formée de nombreuses laîches mais aussi de mousses particulières : les hypnacées. Les tourbières alcalines sont fortement présentes dans les vallées alluviales et les Préalpes calcaires où l'influence des glaciers jurassiens et alpiens a été importante. Elles représentent 55% de la surface des tourbières de la régionLe lac de Maubois est occupé par des cladiaies (formation végétale dominée par le marisque) et des moliniaies (pelouses à base de Molinie bleue). Il est entouré par des saulaies et des roselières. De même, différents trous remplis d'eau sont présents. Plusieurs espèces végétales remarquables s'y développent. Citons par exemple la Fougère des marais, ou encore le Peucédan des marais, toutes deux protégées en région Rhône-Alpes. La faune présente aussi un certain intérêt. Les libellules, en particulier, sont bien représentés avec des demoiselles (Agrion délicat) et des libellules (Cordulie à taches jaunes).
