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Le massif du Bas-Bugey est une région d’une très grande richesse biologique. A l'écart des principales voies de communication, il reste bien préservé. Mais c'est sa physionomie qui présente le plus d'intérêt. De la plaine du Rhône au sommet du massif (Molard Dedon, 1219 m), le dénivelé est de près de 1000 m. Les conditions climatiques rencontrées sur l'ensemble du massif sont particulièrement variées et permettent une grande diversité botanique. Les milieux rencontrés sont aussi divers que tourbières, lacs, forêts montagnardes, pelouses sèches, pâturages, falaises... Le lac d'Arboréiaz se localise dans une combe creusée par l'érosion glaciaire, d'orientation nord-sud, le long de la faille du Molard de Don (Magnin, 1904). Il est ainsi délimité à l'ouest par les côtes de Crâ et de Buis, et par la côte du lac à l'est. Alimenté par les eaux de ruissellement du bassin versant, par des sources (Magnin, 1904) ainsi que par un petit affluent au nord, le lac possède un exutoire principal à son extrémité sud qui rejoint ensuite, dans le village de Colomieu, le ruisseau de l'Agnin, affluent du Gland. On note également en rive est la présence d'un drain parallèle aux berges du lac. Les coteaux en rive ouest sont voués à la fauche ou au pâturage pour les secteurs les moins abruptes, et sinon à la forêt (chênaie pubescente). La côte du lac, en rive orientale, est exclusivement agricole, avec de la maïsiculture dans les secteurs plus ou moins marécageux des zones basses, et de la fauche ou du pâturage sur les pentes. Ces prairies de fauche offrent par ailleurs un grand intérêt du point de vue floristique et faunistique car elles se rapprochent des formations de type Mesobromion (pelouse maigre dominée par une graminée : le Brome dressé). Le lac est placé au milieu d'un vaste marais tourbeux qui l'entoure presque entièrement, à l'exception d'une petite partie de la rive orientale (champ). Les berges sont relativement abruptes, sans "beine", et ne permettent pas le développement de larges ceintures de végétation. Celles-ci se composent en grande partie de Scirpe des étangs et du Phragmite commun. Les zones marécageuses de bord d'eau forment également des radeaux flottants grâce à l'enchevêtrement des racines de Trèfle d'eau et du Marisque. Ces caractéristiques morphologiques (tremblants, rives abruptes, forte densité de Marisque et de Phragmite commun) ne rendent donc pas facile le cheminement au bord du lac et seule la queue au sud du lac est accessible. On note ainsi la présence de cabanes de pêcheurs et d'embarcadères. Hormis le très fort intérêt paysager que représente le site, les communautés animales sont également assez diversifiées, en particulier dans le cas des libellules) avec de très fortes populations d'Agrion à pattes larges et d'Agrion gracieux dans les prairies humides de la queue sud du lac, ainsi que la présence en assez forte densité de l'Aeschne isocèle le long des rives.
