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Le massif du Bugey est une région d’une très grande richesse biologique. A l'écart des principales voies de communication, au moins dans sa partie la plus au sud, il reste bien préservé. L'ensemble est particulièrement diversifié. Le massif du Bugey présente un relief karstique particulièrement marqué : falaises et grottes y sont très nombreuses. La petite zone humide de l’Ermitage est d’une grande richesse botanique : on y rencontre les espèces caractéristiques des marais alcalins de plaine, dont certaines sont très intéressantes. La Thélyptère des marais est une fougère à rhizome traçant formant des populations denses et étendues parmi les "touradons" de laîches, de roseau ou bien en sous-bois. Comme son nom l’indique, elle est inféodée aux milieux marécageux. Hygrophile, elle colonise différents types de zones humides : marais, queues d’étang, bordures alluvionnaires des cours d’eau, boisements marécageux, roselières. La grande Euphorbe des marais est menacée en région Rhône-Alpes à cause du drainage de plus en plus important des marais. Citons aussi l’Oenanthe de Lachenal ou la Gesse des marais. L’Hydrocharis morène est une plante aquatique flottant librement à la surface de l’eau et dont les feuilles sont en forme de cœur. En automne, la plante se retire au fond de l’eau pour remonter à la surface au printemps. Assez bien représentée dans le département de l’Ain, elle est rare et en régression dans le reste de la région.
