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La baie de Portout regroupe sur une surface réduite une remarquable diversité animale et végétale caractéristique des milieux aquatiques des eaux dormantes. Herbiers totalement immergés avec une végétation non vasculaire (characées), herbiers totalement immergés avec une végétation vasculaire (potamots), herbiers avec une végétation flottante (nénuphars), scirpaies (formations végétales dominées par les scirpes), roselières aquatiques et autres se succèdent sur la "benne" du lac. Chaque milieux abrite son propre cortège de plantes et d'animaux, avec parfois des espèces rarissimes dans le département et la région.
