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La baie de Grésine, au-delà de son intérêt paysager indéniable, constitue un site majeur pour la préservation de la flore et de la faune aquatique du lac du Bourget. De nombreuses espèces animales trouvent dans cette zone abritée des conditions favorables tant en période de reproduction qu'en période d'hivernage. Plusieurs espèces rares et protégées d'oiseaux sont ainsi recensées : la Rousserole turdoïde et le Blongios nain par exemple. Les herbiers entièrement immergés et les étendues de nénuphars sont ici particulièrement étendus à l'échelle du lac, et abritent quelques plantes spectaculaires comme le Potamot perfolié et la Naïade marine.
