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La Forêt de Thonon offre une particularité géologique : il s'agit de moraines modelées par l'action des glaciers en une suite de buttes et de dépressions. Comme sa désignation l'indique, cette zone est intégralement boisée d'essences feuillues (chêne - érable) et de quelques îlots de Pin sylvestre. Sa topographie et son sol déterminent deux types de végétation. Les buttes exposées au sud à éléments méridionaux (Erable à feuilles d'obier - Buis…) s'opposent aux espèces montagnardes (Hêtre, Rosier des Alpes, Lys martagon) des fonds de dépression et des situations fraîches. L'acidification de la moraine induit localement la présence d'espèces calcifuges. Cette forêt assez diversifiée en faune (mammifères, oiseaux…) est bordée d'un marais (tourbière basse alcaline) regroupant à lui seul toutes les espèces végétales protégées du site et plusieurs espèces animales de grand intérêt. L'intérêt écologique local, qui s'ajoute à son attrait géologique (morphologie, blocs erratiques siliceux) et touristique (forte fréquentation des riverains thononais), justifie sa préservation dans un contexte de fortes pressions en zone périurbaine.
