La ZNIEFF « Grotte de la source du Jaur » se situe à l'ouest du département de l'Hérault, au sein du Parc naturel régional du Haut-Languedoc aux pieds des Monts du Somail. Elle englobe une partie du versant nord de l'Artenac surplombant la ville de Saint-Pons-de-Thomières. Le territoire défini couvre une surface de 35 hectares et son altitude varie entre 340 et 462 mètres.
Le périmètre de la ZNIEFF est principalement matérialisé à par des sentiers. A l'est, un thalweg marque également la délimitation et au nord, le périmètre contourne les zones d'urbanisation dense de Saint-Pons-de-Thomières mais englobe les parcelles abritant, en sous-sol, les salles de la grotte des sources du Jaur.